More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0895 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  100 
 
 		 471 aa  980    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  40.76 
 
 		 472 aa  361  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  42.26 
 
 		 487 aa  352  7e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  40.13 
 
 		 479 aa  336  5e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  41.63 
 
 		 467 aa  335  1e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  41.55 
 
 		 470 aa  331  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  40.43 
 
 		 500 aa  307  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  38.38 
 
 		 539 aa  302  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  38.15 
 
 		 465 aa  293  5e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  35.11 
 
 		 551 aa  271  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  34.17 
 
 		 559 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  36.36 
 
 		 482 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  36.05 
 
 		 553 aa  264  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  36.5 
 
 		 543 aa  261  3e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  31.6 
 
 		 558 aa  250  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  34.85 
 
 		 462 aa  248  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  33.48 
 
 		 517 aa  247  4e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  34.4 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  34.19 
 
 		 440 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  34.85 
 
 		 495 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  34.86 
 
 		 491 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  35.46 
 
 		 510 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  34.25 
 
 		 438 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  31.53 
 
 		 452 aa  237  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  31.4 
 
 		 457 aa  236  9e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  31.72 
 
 		 486 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  31.94 
 
 		 497 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  33.19 
 
 		 457 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  33.87 
 
 		 491 aa  233  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  34.07 
 
 		 470 aa  232  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  33.19 
 
 		 474 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  35.89 
 
 		 458 aa  231  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  33.63 
 
 		 548 aa  229  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  32.59 
 
 		 471 aa  229  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  33.93 
 
 		 453 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0390  sulfatase  33.69 
 
 		 464 aa  226  7e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  33.18 
 
 		 462 aa  226  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  32.68 
 
 		 486 aa  223  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  34.09 
 
 		 442 aa  223  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  32.57 
 
 		 492 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  32.73 
 
 		 490 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  30.55 
 
 		 500 aa  216  9e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  29.68 
 
 		 460 aa  216  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  30.02 
 
 		 553 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  32.49 
 
 		 453 aa  215  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  33.26 
 
 		 506 aa  214  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  30.92 
 
 		 468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  36.22 
 
 		 631 aa  213  5.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  32.96 
 
 		 482 aa  212  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  32.09 
 
 		 481 aa  210  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  31.59 
 
 		 523 aa  209  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  31.28 
 
 		 489 aa  207  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  32.14 
 
 		 459 aa  206  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01110  arylsulfatase A family protein  31.22 
 
 		 480 aa  205  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  29.24 
 
 		 551 aa  203  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  30.83 
 
 		 483 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  32.11 
 
 		 478 aa  199  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  30.8 
 
 		 480 aa  197  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  31.75 
 
 		 481 aa  197  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  30.74 
 
 		 519 aa  197  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  31.17 
 
 		 497 aa  193  7e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  31.31 
 
 		 497 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  30.47 
 
 		 637 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  31.95 
 
 		 484 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  32.15 
 
 		 489 aa  188  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  30.34 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  30.11 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  29.14 
 
 		 533 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  30.6 
 
 		 520 aa  186  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  31.87 
 
 		 453 aa  186  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  29.44 
 
 		 536 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  28.73 
 
 		 440 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  28.38 
 
 		 480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  30.16 
 
 		 488 aa  184  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  30.18 
 
 		 497 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  30.18 
 
 		 497 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0526  sulfatase  30.61 
 
 		 564 aa  183  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  30.6 
 
 		 497 aa  183  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  30.99 
 
 		 497 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  30.58 
 
 		 497 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  29.85 
 
 		 546 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  28.65 
 
 		 507 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  28.02 
 
 		 500 aa  179  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1879  sulfatase  33.19 
 
 		 462 aa  177  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  29.9 
 
 		 547 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  27.05 
 
 		 543 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  27.27 
 
 		 535 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  27.27 
 
 		 535 aa  176  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  27.27 
 
 		 535 aa  176  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  27.65 
 
 		 542 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  31.03 
 
 		 521 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  30.9 
 
 		 466 aa  174  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4261  sulfatase  28.45 
 
 		 506 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362858 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  29.91 
 
 		 517 aa  173  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  26.68 
 
 		 563 aa  172  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  29.89 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1655  sulfatase  28.14 
 
 		 554 aa  172  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.789399  normal  0.0842498 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  28.49 
 
 		 520 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  28.91 
 
 		 496 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  31.72 
 
 		 508 aa  171  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>