More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0888 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  100 
 
 
517 aa  1082    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  30.85 
 
 
494 aa  213  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  30.93 
 
 
498 aa  202  9e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  30.75 
 
 
499 aa  189  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  30.08 
 
 
508 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  30.6 
 
 
505 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  30.38 
 
 
537 aa  179  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  31.86 
 
 
559 aa  173  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  29.51 
 
 
564 aa  173  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  26.6 
 
 
473 aa  170  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  27.5 
 
 
497 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  27.5 
 
 
497 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  27.5 
 
 
497 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  27.29 
 
 
497 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  27.29 
 
 
497 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4043  sulfatase  27.08 
 
 
497 aa  162  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3441  sulfatase  26.69 
 
 
511 aa  159  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0813077  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  28.16 
 
 
497 aa  157  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  26.15 
 
 
526 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1565  sulfatase  28.72 
 
 
453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717098  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  29.58 
 
 
512 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  30.13 
 
 
482 aa  147  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  29.63 
 
 
515 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  28.27 
 
 
517 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  29.12 
 
 
517 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  27.85 
 
 
522 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  27.85 
 
 
522 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  27.85 
 
 
522 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  27.85 
 
 
522 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  27.85 
 
 
522 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  28.6 
 
 
509 aa  144  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3268  sulfatase  26.26 
 
 
495 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0376086  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1775  sulfatase  25.93 
 
 
587 aa  143  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.819016  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  25.09 
 
 
535 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  28.22 
 
 
496 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  27.78 
 
 
497 aa  141  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  28.97 
 
 
517 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  28.98 
 
 
513 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  27.87 
 
 
519 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  28.29 
 
 
511 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  27.16 
 
 
474 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  27.59 
 
 
508 aa  138  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  26.9 
 
 
501 aa  137  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  27.17 
 
 
510 aa  137  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  26.77 
 
 
485 aa  137  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  26.76 
 
 
519 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  28.73 
 
 
511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2234  sulfatase  27.05 
 
 
506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  24.27 
 
 
481 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  28.29 
 
 
511 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  26.68 
 
 
501 aa  134  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  27.72 
 
 
511 aa  133  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  24.27 
 
 
480 aa  134  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  27.45 
 
 
487 aa  133  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  25.95 
 
 
502 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  27.77 
 
 
516 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0795  sulfatase  25.43 
 
 
549 aa  131  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0245615  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  27.89 
 
 
476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  27.83 
 
 
489 aa  130  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  27.39 
 
 
502 aa  130  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  26.21 
 
 
486 aa  130  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  27.77 
 
 
516 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  24.49 
 
 
482 aa  130  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  28.03 
 
 
496 aa  130  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2763  sulfatase  25.4 
 
 
478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1701  sulfatase  25.86 
 
 
475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.987903  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  28.04 
 
 
518 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  24.85 
 
 
503 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  26.54 
 
 
594 aa  128  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  28.21 
 
 
520 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1519  sulfatase  25.84 
 
 
537 aa  127  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0408631  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  26.37 
 
 
512 aa  126  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  25.82 
 
 
478 aa  127  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  27.55 
 
 
516 aa  126  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  27.55 
 
 
516 aa  126  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  24.17 
 
 
479 aa  126  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  26.95 
 
 
467 aa  125  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  25.67 
 
 
518 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  26.43 
 
 
502 aa  125  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  25.64 
 
 
458 aa  124  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  25.61 
 
 
503 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  28.91 
 
 
492 aa  124  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  24.89 
 
 
505 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  23.63 
 
 
499 aa  123  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  28.12 
 
 
504 aa  123  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  24.78 
 
 
503 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05040  arylsulfatase A family protein  27.69 
 
 
474 aa  123  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  22.9 
 
 
535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  25.3 
 
 
505 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  27.8 
 
 
502 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  25.25 
 
 
453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  26.3 
 
 
470 aa  119  9e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  24.12 
 
 
440 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  25.86 
 
 
467 aa  119  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  25.59 
 
 
505 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  24.6 
 
 
586 aa  118  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  25.59 
 
 
505 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  24.65 
 
 
565 aa  117  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  25.3 
 
 
500 aa  117  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  25.52 
 
 
491 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>