More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0881 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  100 
 
 
510 aa  1063  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  42.92 
 
 
482 aa  359  8e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  42.39 
 
 
478 aa  358  1e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  42.35 
 
 
470 aa  347  3e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  37.67 
 
 
631 aa  311  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  38.3 
 
 
492 aa  294  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  35.76 
 
 
490 aa  265  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  33.47 
 
 
517 aa  262  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  37.45 
 
 
484 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  34.23 
 
 
489 aa  247  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  35.46 
 
 
471 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  32.53 
 
 
637 aa  231  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  33.21 
 
 
517 aa  226  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2725  sulfatase  33.07 
 
 
724 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0744828  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  32.37 
 
 
470 aa  219  7e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  33.26 
 
 
457 aa  219  9e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  34.19 
 
 
501 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  32.54 
 
 
539 aa  219  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  31.01 
 
 
500 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0583  sulfatase  32.48 
 
 
522 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  32.38 
 
 
553 aa  217  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  31.95 
 
 
487 aa  216  6e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  30.83 
 
 
452 aa  213  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  32.73 
 
 
497 aa  213  8e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  34.03 
 
 
460 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  34.47 
 
 
472 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  33.55 
 
 
440 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  31.35 
 
 
495 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  32.76 
 
 
497 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  32.76 
 
 
497 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1655  sulfatase  31.49 
 
 
554 aa  208  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.789399  normal  0.0842498 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  32.57 
 
 
497 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  32.87 
 
 
543 aa  208  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  32.57 
 
 
497 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3390  sulfatase  30.91 
 
 
513 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0663726  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  32.43 
 
 
497 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1755  sulfatase  31.06 
 
 
562 aa  206  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  31.89 
 
 
548 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  32.18 
 
 
497 aa  202  1e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  30.77 
 
 
551 aa  202  1e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  32.35 
 
 
479 aa  202  2e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  31.21 
 
 
491 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  31.24 
 
 
438 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  31.26 
 
 
465 aa  196  6e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  31.24 
 
 
453 aa  196  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  32.85 
 
 
491 aa  193  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  28.84 
 
 
533 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  31.26 
 
 
559 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  30.96 
 
 
453 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  30.97 
 
 
536 aa  189  8e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  32.17 
 
 
471 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  30.41 
 
 
457 aa  189  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1879  sulfatase  30.63 
 
 
462 aa  187  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  30.78 
 
 
474 aa  187  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  28.83 
 
 
482 aa  186  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  29.56 
 
 
553 aa  186  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  29.9 
 
 
462 aa  185  1e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  31.4 
 
 
481 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  30.42 
 
 
467 aa  184  4e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  29.81 
 
 
453 aa  182  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  30.64 
 
 
506 aa  180  6e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  29.61 
 
 
486 aa  180  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  30.65 
 
 
497 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  30.28 
 
 
459 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  29.54 
 
 
466 aa  178  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  30.16 
 
 
627 aa  178  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  31.19 
 
 
457 aa  177  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  29.81 
 
 
542 aa  175  2e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  30.21 
 
 
486 aa  174  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  27.34 
 
 
558 aa  173  6e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  29.93 
 
 
442 aa  173  8e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  29.26 
 
 
551 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  30.41 
 
 
489 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  29.74 
 
 
442 aa  169  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  29.35 
 
 
462 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  28.02 
 
 
543 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0390  sulfatase  30.8 
 
 
464 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  31.14 
 
 
458 aa  169  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  28.74 
 
 
555 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  28.01 
 
 
542 aa  166  9e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  31.46 
 
 
468 aa  166  1e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  30.22 
 
 
500 aa  166  1e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  31.99 
 
 
500 aa  165  2e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  29.36 
 
 
523 aa  163  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  27.7 
 
 
440 aa  162  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0426  sulfatase  29.47 
 
 
772 aa  161  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452033  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  29.88 
 
 
480 aa  161  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01110  arylsulfatase A family protein  27.74 
 
 
480 aa  161  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0383  sulfatase  27.51 
 
 
563 aa  160  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  26.97 
 
 
480 aa  159  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3043  sulfatase  30.04 
 
 
560 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0150299  hitchhiker  0.0001034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2624  arylsulfatase  27.29 
 
 
541 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.344429  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  28.57 
 
 
479 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  25.97 
 
 
578 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  27.41 
 
 
483 aa  157  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  6.43806e-07  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  29.39 
 
 
481 aa  157  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  31.74 
 
 
581 aa  156  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  26.92 
 
 
519 aa  156  9e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2053  sulfatase  28.65 
 
 
556 aa  154  3e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.627693  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2981  sulfatase  28.47 
 
 
766 aa  154  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>