201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0871 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0871  siderophore-interacting protein  100 
 
 
247 aa  509  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314795  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0096  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  61.07 
 
 
248 aa  324  7e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  60.66 
 
 
248 aa  322  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0091  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  60.66 
 
 
250 aa  322  4e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4255  siderophore-interacting protein  60.25 
 
 
250 aa  319  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0096  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  60.25 
 
 
247 aa  317  9e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0076  siderophore-interacting protein  59.76 
 
 
251 aa  317  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0099  siderophore-interacting protein  59.43 
 
 
252 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0094  siderophore-interacting protein  58.61 
 
 
250 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2184  siderophore-interacting protein  55.92 
 
 
246 aa  291  8e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  normal  0.170908 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000911  utilization protein for catechol-siderophore  45.04 
 
 
257 aa  229  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06920  hypothetical protein  45.31 
 
 
272 aa  228  8e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0997  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  49.28 
 
 
210 aa  211  9e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18529e-07 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03816  putative siderophore utilization protein  44.4 
 
 
257 aa  203  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  36.72 
 
 
281 aa  162  4e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  34.8 
 
 
277 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1802  vibriobactin utilization protein ViuB  33.6 
 
 
271 aa  159  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2366  Siderophore-interacting protein  34.66 
 
 
258 aa  135  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.277442  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  34.01 
 
 
281 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.22 
 
 
283 aa  134  1e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0918  Siderophore-interacting protein  33.72 
 
 
273 aa  134  1e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2919  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.07 
 
 
272 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  32.94 
 
 
288 aa  132  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1159  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.42 
 
 
281 aa  131  1e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139634  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0118  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.97 
 
 
370 aa  130  2e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.33 
 
 
279 aa  129  5e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0127  siderophore-interacting protein  36.89 
 
 
266 aa  127  1e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.636914  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  31.52 
 
 
297 aa  127  1e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  33.33 
 
 
255 aa  127  1e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  33.33 
 
 
275 aa  127  2e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  33.33 
 
 
275 aa  127  2e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  33.33 
 
 
275 aa  127  2e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  33.33 
 
 
275 aa  127  2e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  33.33 
 
 
275 aa  127  2e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  33.33 
 
 
275 aa  127  2e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  33.74 
 
 
275 aa  127  2e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  34.29 
 
 
270 aa  127  2e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  34.31 
 
 
247 aa  127  2e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  33.33 
 
 
275 aa  127  2e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  33.09 
 
 
304 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  32.94 
 
 
279 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  32.94 
 
 
311 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4106  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.28 
 
 
280 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.85 
 
 
273 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  32.49 
 
 
275 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  30.99 
 
 
265 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  30.66 
 
 
340 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  5.30029e-05 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5386  Siderophore-interacting protein  33.06 
 
 
251 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0562315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4137  siderophore-interacting protein  31.27 
 
 
281 aa  122  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  32.7 
 
 
617 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  33.61 
 
 
274 aa  121  1e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  33.87 
 
 
261 aa  120  1e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2401  Siderophore-interacting protein  30.45 
 
 
276 aa  120  1e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000149826  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  31.45 
 
 
273 aa  120  2e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  32.52 
 
 
255 aa  120  2e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25640  siderophore-interacting protein  32.8 
 
 
274 aa  119  5e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.819064  normal  0.256648 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  30.65 
 
 
273 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  30.65 
 
 
273 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  31.05 
 
 
289 aa  118  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  30.65 
 
 
273 aa  118  8e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.48 
 
 
274 aa  118  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.17 
 
 
270 aa  118  1e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  33.6 
 
 
252 aa  117  2e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.39 
 
 
283 aa  117  2e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2205  siderophore-interacting protein  30.82 
 
 
281 aa  117  2e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2309  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  32.47 
 
 
272 aa  117  2e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  31.02 
 
 
623 aa  117  2e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  30.24 
 
 
273 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0336  siderophore-interacting protein  32.28 
 
 
361 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.39 
 
 
253 aa  116  4e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  30.38 
 
 
290 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1773  siderophore-interacting protein  35.68 
 
 
354 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  29.8 
 
 
278 aa  115  7e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  30.49 
 
 
273 aa  115  7e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2392  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  29.74 
 
 
264 aa  115  7e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1901  siderophore-interacting protein  32.3 
 
 
366 aa  115  8e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12909  mycobactin utilization protein viuB  32.26 
 
 
283 aa  114  1e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.3443e-14  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2266  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.57 
 
 
267 aa  114  1e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0112  Siderophore-interacting protein  31.37 
 
 
277 aa  113  2e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  31.98 
 
 
253 aa  114  2e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  30.12 
 
 
280 aa  112  4e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  30.83 
 
 
284 aa  112  4e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3395  vibriobactin utilization protein ViuB  30.57 
 
 
295 aa  112  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.472238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  31.98 
 
 
253 aa  112  7e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3687  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.15 
 
 
289 aa  111  1e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443256  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2259  FAD-binding 9, siderophore-interacting  26.19 
 
 
254 aa  110  1e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  30.12 
 
 
277 aa  111  1e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3016  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.62 
 
 
275 aa  111  1e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1968  siderophore-interacting protein  30.39 
 
 
285 aa  110  2e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2034  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  30.04 
 
 
285 aa  109  4e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870658  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1988  FAD-binding 9, siderophore-interacting  30.04 
 
 
285 aa  109  4e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17630  siderophore-interacting protein  32.3 
 
 
285 aa  108  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.868687  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0773  siderophore-interacting protein  31.18 
 
 
279 aa  108  9e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.71701  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2448  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.36 
 
 
256 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3647  siderophore-interacting protein  31.78 
 
 
273 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.8 
 
 
271 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  28.34 
 
 
277 aa  105  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  28.97 
 
 
267 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4373  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.39 
 
 
277 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0726253  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5136  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.84 
 
 
278 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509715  normal  0.24311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>