117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0842 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  100 
 
 		 546 aa  1134    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  40.91 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  41.87 
 
 		 519 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  40.81 
 
 		 512 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  36.8 
 
 		 566 aa  320  3.9999999999999996e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  36.58 
 
 		 563 aa  303  7.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.03 
 
 		 538 aa  296  5e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  33.4 
 
 		 577 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  34.75 
 
 		 581 aa  281  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  35.36 
 
 		 517 aa  277  3e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.81 
 
 		 558 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.46 
 
 		 515 aa  272  9e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  33.78 
 
 		 556 aa  262  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  34.42 
 
 		 496 aa  262  1e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  34.53 
 
 		 484 aa  254  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  33.27 
 
 		 497 aa  253  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  32.52 
 
 		 512 aa  252  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.21 
 
 		 547 aa  250  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  41.37 
 
 		 542 aa  249  8e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  32.07 
 
 		 550 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  31.32 
 
 		 571 aa  239  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  33.08 
 
 		 523 aa  232  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  31.16 
 
 		 514 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  32.84 
 
 		 532 aa  222  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.87 
 
 		 546 aa  216  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.73 
 
 		 541 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  31.32 
 
 		 498 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  32.66 
 
 		 540 aa  214  3.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  41.11 
 
 		 451 aa  209  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.59 
 
 		 537 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.74 
 
 		 488 aa  204  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.92 
 
 		 539 aa  203  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.05 
 
 		 537 aa  203  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  30.25 
 
 		 492 aa  200  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  40 
 
 		 586 aa  196  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  29.95 
 
 		 541 aa  196  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  39.66 
 
 		 526 aa  194  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.02 
 
 		 536 aa  192  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  29.26 
 
 		 636 aa  184  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  27.8 
 
 		 539 aa  184  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.36 
 
 		 559 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.01 
 
 		 558 aa  182  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  38.95 
 
 		 497 aa  179  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  29.2 
 
 		 546 aa  172  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  28.81 
 
 		 553 aa  161  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.95 
 
 		 562 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  31.48 
 
 		 590 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  26.08 
 
 		 536 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  27.98 
 
 		 543 aa  143  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  27.39 
 
 		 522 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  25.14 
 
 		 551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  25.98 
 
 		 532 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  31.72 
 
 		 552 aa  139  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  24.86 
 
 		 560 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  25.43 
 
 		 572 aa  139  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  29.84 
 
 		 591 aa  136  9e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  25.97 
 
 		 522 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  24.74 
 
 		 650 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  27.37 
 
 		 522 aa  133  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  25.47 
 
 		 537 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  28.18 
 
 		 518 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  25.18 
 
 		 746 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.05 
 
 		 540 aa  118  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  26.14 
 
 		 527 aa  117  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  26.48 
 
 		 537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  25.61 
 
 		 535 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  25.27 
 
 		 1195 aa  114  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  26.13 
 
 		 525 aa  114  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  26.49 
 
 		 503 aa  109  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  27.68 
 
 		 547 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  24.8 
 
 		 518 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  27.01 
 
 		 504 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  24.53 
 
 		 665 aa  104  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  25.97 
 
 		 530 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  24.76 
 
 		 691 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  28.03 
 
 		 1338 aa  101  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  23.84 
 
 		 545 aa  100  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  24.89 
 
 		 534 aa  98.2  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  29.47 
 
 		 511 aa  98.6  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  23.01 
 
 		 508 aa  98.2  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  28.79 
 
 		 495 aa  94  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  25.35 
 
 		 1474 aa  92.8  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  23.69 
 
 		 532 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  23.6 
 
 		 472 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  24.35 
 
 		 500 aa  91.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  24.23 
 
 		 524 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  22.44 
 
 		 1585 aa  82  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  22.93 
 
 		 797 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  34.51 
 
 		 521 aa  80.1  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  28.37 
 
 		 365 aa  80.1  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  38.46 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  25.31 
 
 		 522 aa  70.9  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  23.62 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  36.09 
 
 		 901 aa  69.7  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  28.72 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3109  glycoside hydrolase family protein  27.46 
 
 		 348 aa  67  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  26.02 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  22.62 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 		 325 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  26.56 
 
 		 855 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>