72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0633 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 234 aa  489  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  42.24 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  37.29 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 		 232 aa  147  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.44 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  34.68 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  34.32 
 
 		 236 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  32.77 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  33.47 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  32.49 
 
 		 236 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  32.34 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  32.34 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  32.34 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  32.34 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  32.34 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  32.34 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  32.34 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 		 236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 		 288 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  31.36 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  32.88 
 
 		 236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  33.61 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.49 
 
 		 236 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 250 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  32.77 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  32.48 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  32.17 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  31.95 
 
 		 223 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  34.86 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  32.05 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  32.05 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.62 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 		 224 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 		 224 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  28.77 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  30.59 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  34.4 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 224 aa  99  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  28.31 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 		 222 aa  88.6  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  28.15 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  28.7 
 
 		 222 aa  85.5  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  24.34 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  28.51 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  24.23 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  24.29 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 		 221 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 		 221 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  32.98 
 
 		 206 aa  45.4  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  33.68 
 
 		 208 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.67 
 
 		 444 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  30.12 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5335  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.48 
 
 		 157 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0226085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.81 
 
 		 165 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4549  phosphoglycerate mutase  27.71 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  31.73 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.17 
 
 		 442 aa  43.5  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  33.68 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  34.72 
 
 		 211 aa  42  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.72 
 
 		 442 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>