232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0605 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0605  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  57.75 
 
 		 203 aa  224  7e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  57.75 
 
 		 203 aa  224  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  57.75 
 
 		 203 aa  224  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  57.92 
 
 		 207 aa  221  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  56.83 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  58.79 
 
 		 204 aa  203  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  63.58 
 
 		 203 aa  201  8e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  55.11 
 
 		 204 aa  198  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  62.25 
 
 		 203 aa  195  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  49.5 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  48.26 
 
 		 204 aa  191  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2535  hypothetical protein  57.54 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000701111  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  46.27 
 
 		 204 aa  181  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  49.5 
 
 		 204 aa  177  8e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  51 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  51 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000121216  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  51 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  0.0000831038 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  50.5 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  50.5 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000068448  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  51 
 
 		 204 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  51 
 
 		 204 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  50.5 
 
 		 204 aa  175  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4371  hypothetical protein  50 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4215  hypothetical protein  50 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000733457  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4311  hypothetical protein  50 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.36951 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4192  hypothetical protein  50 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121716  normal  0.896932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4264  hypothetical protein  50 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  44.9 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  45.51 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  46.63 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  44.1 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1571  hypothetical protein  48.21 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  45.05 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  43.59 
 
 		 204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  46.07 
 
 		 211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  43.26 
 
 		 204 aa  161  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  46.39 
 
 		 208 aa  160  9e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  40.89 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  41.84 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  45.88 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  42.35 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  42.31 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  42.35 
 
 		 204 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  0.0000000252745 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  42.56 
 
 		 204 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  46.2 
 
 		 176 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  40.43 
 
 		 219 aa  152  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  43.96 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  41.67 
 
 		 205 aa  145  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  45.03 
 
 		 274 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  44.32 
 
 		 205 aa  142  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  42.77 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  34.72 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0014  hypothetical protein  48.39 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  36.26 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  37.14 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  40.1 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  37.28 
 
 		 209 aa  126  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  38 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  34.76 
 
 		 201 aa  121  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  37.13 
 
 		 245 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  35.23 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  36.73 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  34.07 
 
 		 211 aa  115  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  42.66 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  30.94 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  42.86 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  35.37 
 
 		 198 aa  113  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  40.59 
 
 		 194 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  37.5 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  42.58 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  35.93 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  42.66 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  39.1 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000582787  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  35.42 
 
 		 204 aa  111  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  37.58 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  43.36 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  37.5 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  41.29 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  36.36 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  36.02 
 
 		 197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.23 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  41.94 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  37.82 
 
 		 194 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  35.98 
 
 		 195 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0593  hypothetical protein  47.79 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195431  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  37.2 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0633  hypothetical protein  47.79 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000102941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  36.71 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  35.11 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  35.75 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  42.86 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3700  hypothetical protein  37.5 
 
 		 194 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  42.11 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0695  hypothetical protein  43.79 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  37.43 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  32.54 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  35.8 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  40.27 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  36.02 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>