More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0567 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  100 
 
 
241 aa  490  1e-138  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  86.31 
 
 
241 aa  433  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  76.76 
 
 
241 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  78.66 
 
 
243 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  75.93 
 
 
241 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  76.99 
 
 
246 aa  381  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  75.1 
 
 
241 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  74.27 
 
 
241 aa  374  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  78.24 
 
 
243 aa  374  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  78.24 
 
 
243 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  78.24 
 
 
243 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  78.24 
 
 
243 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  78.24 
 
 
243 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  78.24 
 
 
243 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  78.24 
 
 
243 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  74.69 
 
 
241 aa  370  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  78.24 
 
 
243 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3087  ABC transporter, ATP-binding protein  76.57 
 
 
243 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187467  normal  0.113266 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  77.92 
 
 
243 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  73.03 
 
 
241 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  76.99 
 
 
243 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  73.03 
 
 
241 aa  363  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  71.78 
 
 
241 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  71.78 
 
 
241 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  71.78 
 
 
241 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  71.78 
 
 
241 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  71.78 
 
 
241 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3310  ABC transporter-related protein  76.47 
 
 
243 aa  362  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000131342  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  77.41 
 
 
243 aa  362  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  8.91993e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  72.61 
 
 
241 aa  362  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0716  ABC transporter related  77.82 
 
 
243 aa  361  5e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0818834  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  70.95 
 
 
241 aa  361  6e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  70.54 
 
 
241 aa  361  6e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  71.37 
 
 
241 aa  360  9e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  70.95 
 
 
241 aa  360  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  70.95 
 
 
241 aa  360  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0727  ABC transporter-related protein  76.99 
 
 
243 aa  360  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  71.37 
 
 
241 aa  359  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  71.37 
 
 
241 aa  359  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  70.95 
 
 
241 aa  359  3e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  72.2 
 
 
241 aa  358  4e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  71.78 
 
 
241 aa  358  6e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  71.37 
 
 
241 aa  357  8e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  71.37 
 
 
241 aa  357  9e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  71.78 
 
 
241 aa  357  1e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03017  hypothetical protein  73.03 
 
 
241 aa  355  3e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00220423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3569  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  73.03 
 
 
241 aa  355  3e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0499  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  73.03 
 
 
241 aa  355  3e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406255  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3394  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  73.03 
 
 
241 aa  355  3e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3497  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  73.03 
 
 
241 aa  355  3e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03066  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  73.03 
 
 
241 aa  355  3e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00157983  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4523  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  73.03 
 
 
241 aa  355  3e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0506  ABC transporter related protein  73.03 
 
 
241 aa  355  3e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2714  ABC transporter related  73.03 
 
 
241 aa  354  6e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  70.54 
 
 
241 aa  354  6e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3689  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  72.61 
 
 
241 aa  354  8e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  70.54 
 
 
241 aa  353  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  69.29 
 
 
241 aa  349  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1152  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  73.03 
 
 
241 aa  347  9e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0506  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  73.03 
 
 
241 aa  347  9e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.503338  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0442  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  73.03 
 
 
241 aa  347  9e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  68.05 
 
 
249 aa  344  6e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  68.05 
 
 
249 aa  344  6e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  67.22 
 
 
259 aa  339  3e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2792  ABC transporter, ATPase subunit  65.98 
 
 
241 aa  336  2e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  65.98 
 
 
241 aa  331  5e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  65.98 
 
 
241 aa  331  5e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2417  ABC transporter related  67.63 
 
 
241 aa  329  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0204694 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  63.9 
 
 
265 aa  329  2e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  63.49 
 
 
241 aa  328  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  64.32 
 
 
265 aa  328  6e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  65.98 
 
 
241 aa  328  7e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  64.73 
 
 
241 aa  325  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0826  ABC transporter related  66.09 
 
 
271 aa  323  1e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  63.33 
 
 
268 aa  318  4e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  61.41 
 
 
240 aa  315  3e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  63.03 
 
 
247 aa  311  7e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0973  ABC transporter related  62.5 
 
 
240 aa  309  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.156124  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  60.66 
 
 
255 aa  306  1e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  59.59 
 
 
258 aa  306  2e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  61.76 
 
 
241 aa  304  8e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  59.18 
 
 
258 aa  304  8e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 
258 aa  303  1e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 
258 aa  303  1e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 
258 aa  303  1e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 
258 aa  303  1e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 
258 aa  303  1e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 
258 aa  303  1e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  59.18 
 
 
258 aa  303  1e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  58.78 
 
 
258 aa  303  2e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  58.2 
 
 
262 aa  303  2e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  58.2 
 
 
262 aa  303  2e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  58.78 
 
 
258 aa  303  2e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  58.61 
 
 
262 aa  303  2e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  58.78 
 
 
258 aa  302  2e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 
258 aa  303  2e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  58.78 
 
 
261 aa  303  2e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  58.37 
 
 
261 aa  302  3e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  59.18 
 
 
258 aa  302  3e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  59.18 
 
 
258 aa  302  3e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0148157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>