161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0547 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  286  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  73.57 
 
 		 142 aa  216  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  54.68 
 
 		 148 aa  164  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  55.4 
 
 		 140 aa  143  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  49.28 
 
 		 168 aa  137  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  58.54 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  49.29 
 
 		 178 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  51.08 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  52.17 
 
 		 141 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  51.45 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  52.17 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  50.72 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  50.39 
 
 		 178 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  50.72 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  51.2 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  46.76 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  45 
 
 		 178 aa  120  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  45 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  51.61 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  44.93 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  117  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  44.29 
 
 		 178 aa  117  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  46.76 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  50.81 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  49.21 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  45.32 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  52.46 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  46.76 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  42.34 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  51.64 
 
 		 140 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  45.32 
 
 		 141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  47.52 
 
 		 140 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  49.19 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  45.65 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  45.32 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  48.39 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0553  hypothetical protein  47.52 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  45.32 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  45.32 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  45.65 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  46.81 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  46.83 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  45.65 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2740  hypothetical protein  45.65 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0366  hypothetical protein  47.14 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1225  hypothetical protein  47.14 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  47.15 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2449  hypothetical protein  47.14 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.906177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3446  hypothetical protein  47.14 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  47.52 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  46.1 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  46.1 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  46.1 
 
 		 140 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  44.93 
 
 		 138 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  47.15 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  43.48 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1215  hypothetical protein  46.43 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  45.16 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3411  hypothetical protein  47.1 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3446  hypothetical protein  47.1 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.600198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2636  hypothetical protein  47.1 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  44.29 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  41.5 
 
 		 194 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  41.38 
 
 		 177 aa  107  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  42.86 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  44.68 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  44.2 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  41.3 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3572  hypothetical protein  41.5 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  43.07 
 
 		 136 aa  103  7e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2830  hypothetical protein  45.9 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179032  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0385  hypothetical protein  37.68 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  36.96 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  39.86 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1594  hypothetical protein  36.96 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0246  hypothetical protein  43.57 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2969  hypothetical protein  45.9 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  41.01 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  39.13 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0328  hypothetical protein  45.24 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  45.24 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  41.3 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2893  hypothetical protein  41.55 
 
 		 165 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337195  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1232  putative integral membrane protein  41.55 
 
 		 165 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  45.97 
 
 		 172 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0381  hypothetical protein  45.71 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  40.15 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3207  hypothetical protein  41.73 
 
 		 180 aa  99.4  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0281  hypothetical protein  44.72 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.440714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  40.15 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3804  hypothetical protein  42.06 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000216317  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  38.78 
 
 		 187 aa  97.4  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2669  hypothetical protein  40.14 
 
 		 165 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00312015  normal  0.333956 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2472  hypothetical protein  42.45 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0258  hypothetical protein  40.15 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  38.85 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  40.58 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0307  putative transmembrane protein  43.57 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716288 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>