More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0512 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0512  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  340  5.999999999999999e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3819  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 155 aa  163  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6556  transcriptional regulator, AsnC family  44.08 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.604564  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  46.05 
 
 		 203 aa  134  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2850  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  41.22 
 
 		 167 aa  130  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.89 
 
 		 169 aa  124  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  43.24 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  43.97 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2542  transcriptional regulator, AsnC family  39.72 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.44011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  39.86 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  41.13 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8185  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 180 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  39.47 
 
 		 157 aa  107  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  35.62 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4335  transcriptional regulator, AsnC family  37.86 
 
 		 173 aa  101  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  34.87 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 179 aa  100  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 165 aa  97.8  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 154 aa  97.8  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  33.1 
 
 		 158 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 172 aa  94  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 162 aa  94  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 162 aa  94  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  36.99 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  34.23 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3254  transcriptional regulator, AsnC family  36.09 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  33.55 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  34.06 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2383  transcriptional regulator, AsnC family  35.97 
 
 		 152 aa  92.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000319505  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 169 aa  92  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 161 aa  91.7  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 181 aa  91.3  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  31.88 
 
 		 160 aa  90.9  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 166 aa  90.9  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7861  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.17 
 
 		 150 aa  90.5  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0789573  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 170 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 		 154 aa  90.5  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  33.55 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  33.55 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  33.55 
 
 		 229 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  33.55 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  33.55 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  33.58 
 
 		 153 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  37.68 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 202 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  33.58 
 
 		 153 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  34.04 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 156 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  32.68 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 157 aa  88.6  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 168 aa  88.2  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 156 aa  88.2  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 174 aa  88.2  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  32.89 
 
 		 156 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 171 aa  87.8  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 156 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 160 aa  87.8  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.5 
 
 		 153 aa  87.8  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 159 aa  87.8  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 218 aa  87.4  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>