More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0486 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 284 aa  594  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00467  formyltetrahydrofolate deformylase  80.15 
 
 		 267 aa  457  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  61.13 
 
 		 284 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  61.57 
 
 		 282 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  61.7 
 
 		 283 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  60.85 
 
 		 283 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  60.5 
 
 		 283 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  60.85 
 
 		 283 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  60.85 
 
 		 283 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  60.5 
 
 		 283 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  59.43 
 
 		 283 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  59.22 
 
 		 283 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  59.79 
 
 		 283 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  59.79 
 
 		 283 aa  361  9e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  55.99 
 
 		 288 aa  361  9e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  56.89 
 
 		 285 aa  353  2e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  56.07 
 
 		 290 aa  352  5e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  57.24 
 
 		 286 aa  350  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  56.89 
 
 		 283 aa  345  6e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  55.6 
 
 		 287 aa  342  2.9999999999999997e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  57.19 
 
 		 289 aa  335  5e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  54.01 
 
 		 291 aa  334  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  54.15 
 
 		 296 aa  328  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  53.43 
 
 		 287 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  51.22 
 
 		 291 aa  320  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  51.76 
 
 		 282 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 292 aa  300  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3654  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 290 aa  301  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  51.08 
 
 		 297 aa  299  4e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 316 aa  297  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 287 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  46.29 
 
 		 283 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  45.94 
 
 		 296 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  48.38 
 
 		 303 aa  281  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 287 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  47.31 
 
 		 287 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  46.13 
 
 		 289 aa  278  6e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  46.59 
 
 		 282 aa  278  8e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 		 285 aa  278  9e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 		 287 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  48.41 
 
 		 300 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  46.83 
 
 		 284 aa  276  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 		 288 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  46.9 
 
 		 294 aa  275  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 		 289 aa  275  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 289 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  47.37 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  47.35 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  48.76 
 
 		 282 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  48.57 
 
 		 289 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  46.21 
 
 		 294 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  47.02 
 
 		 294 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  47.02 
 
 		 294 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  47.31 
 
 		 287 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4965  formyltetrahydrofolate deformylase  45.91 
 
 		 289 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 		 287 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 		 287 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  46.79 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1157  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 		 284 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  45.49 
 
 		 294 aa  269  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  45.49 
 
 		 294 aa  269  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0941  formyltetrahydrofolate deformylase  48.92 
 
 		 283 aa  269  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  48.6 
 
 		 282 aa  269  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  48.6 
 
 		 282 aa  269  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 		 282 aa  269  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  47.54 
 
 		 291 aa  268  7e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  46.98 
 
 		 284 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  47.69 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  47.48 
 
 		 284 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  46.32 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  46.32 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 		 288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  47.48 
 
 		 288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  46.74 
 
 		 288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  47.12 
 
 		 284 aa  266  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  46.83 
 
 		 293 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 		 288 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  46.93 
 
 		 282 aa  265  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  43.46 
 
 		 284 aa  265  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1837  formyltetrahydrofolate deformylase  43.73 
 
 		 290 aa  265  5.999999999999999e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  45.68 
 
 		 293 aa  265  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  44.88 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  47.12 
 
 		 288 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2830  formyltetrahydrofolate deformylase  45.49 
 
 		 294 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.694192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  44.88 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  46.29 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  45.85 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2952  formyltetrahydrofolate deformylase  46.37 
 
 		 293 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.855251  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  47.14 
 
 		 288 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3097  formyltetrahydrofolate deformylase  46.37 
 
 		 293 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1524  formyltetrahydrofolate deformylase  46.37 
 
 		 293 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0066  formyltetrahydrofolate deformylase  46.37 
 
 		 293 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  45.13 
 
 		 294 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  43.46 
 
 		 284 aa  262  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 		 307 aa  262  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  46.1 
 
 		 287 aa  262  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  46.21 
 
 		 286 aa  262  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1188  formyltetrahydrofolate deformylase  44.52 
 
 		 286 aa  261  6.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000131662 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2508  formyltetrahydrofolate deformylase  45.52 
 
 		 288 aa  261  6.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>