More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0466 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  48.54 
 
 		 1138 aa  1070    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  49.28 
 
 		 1067 aa  1051    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  48.27 
 
 		 1071 aa  1046    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  47.45 
 
 		 1049 aa  1024    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  68.52 
 
 		 1111 aa  1637    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  49.15 
 
 		 1062 aa  1050    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  48.96 
 
 		 1062 aa  1052    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  48.77 
 
 		 1062 aa  1045    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  47.92 
 
 		 1065 aa  1037    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  43.72 
 
 		 1078 aa  915    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  48.91 
 
 		 1066 aa  1050    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  100 
 
 		 1113 aa  2305    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  47.11 
 
 		 1062 aa  1035    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  46.65 
 
 		 1062 aa  1031    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  49.53 
 
 		 1060 aa  1059    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  44.32 
 
 		 1062 aa  942    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  48.22 
 
 		 1069 aa  1063    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  42.37 
 
 		 1084 aa  913    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  46.47 
 
 		 1062 aa  1024    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  48.64 
 
 		 1081 aa  1061    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  49.39 
 
 		 1062 aa  1060    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  48.01 
 
 		 1062 aa  1032    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  50.25 
 
 		 598 aa  622  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  47.23 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  27.73 
 
 		 1052 aa  353  8e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  24.46 
 
 		 1005 aa  181  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1042 aa  171  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  23.16 
 
 		 1059 aa  165  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  23.37 
 
 		 1040 aa  164  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  23.32 
 
 		 1042 aa  162  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  23.27 
 
 		 1014 aa  148  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  23.42 
 
 		 1031 aa  144  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  28.18 
 
 		 666 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  23.27 
 
 		 1125 aa  84.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  23.41 
 
 		 496 aa  82.4  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  23.96 
 
 		 672 aa  80.9  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  28.46 
 
 		 445 aa  79.7  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  24.33 
 
 		 1090 aa  79.3  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  25.06 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  23.97 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  41.67 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  41.67 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.93 
 
 		 407 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  26.93 
 
 		 702 aa  77.4  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  29.44 
 
 		 419 aa  76.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.83 
 
 		 670 aa  77  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  41.67 
 
 		 434 aa  77  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  25.06 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  25.27 
 
 		 1193 aa  75.1  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  23.11 
 
 		 590 aa  75.5  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  30.43 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  30.77 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  31.1 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  26.68 
 
 		 1010 aa  74.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.25 
 
 		 407 aa  74.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  30.82 
 
 		 427 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  26.15 
 
 		 440 aa  74.3  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  26.15 
 
 		 437 aa  74.7  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  23.36 
 
 		 431 aa  74.3  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  23.67 
 
 		 407 aa  73.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  23.45 
 
 		 478 aa  72.8  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  26.64 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  22.64 
 
 		 430 aa  73.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.18 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  26.2 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.31 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.57 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  26.59 
 
 		 567 aa  71.6  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  25.78 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  24.06 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 432 aa  70.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  28.44 
 
 		 572 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.65 
 
 		 446 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  34.19 
 
 		 969 aa  71.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.18 
 
 		 442 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  36.7 
 
 		 615 aa  70.1  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0118  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.48 
 
 		 687 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125913  normal  0.195999 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  22.73 
 
 		 438 aa  70.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.86 
 
 		 674 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  27.27 
 
 		 674 aa  69.7  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  29.19 
 
 		 568 aa  69.7  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  27.36 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.14 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1155  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  30.14 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  33.54 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.27 
 
 		 674 aa  68.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  24.83 
 
 		 483 aa  68.9  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  27.23 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1561  WD40 domain-containing protein  27 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  22.86 
 
 		 490 aa  68.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  30.24 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.07 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.38 
 
 		 673 aa  68.6  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.07 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  26.03 
 
 		 1082 aa  68.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  20.67 
 
 		 540 aa  68.2  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  27.27 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0859  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  22.71 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  22.35 
 
 		 451 aa  67.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  23.95 
 
 		 692 aa  67.8  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>