More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0464 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03191  elongation factor EF-2  54.45 
 
 		 704 aa  752    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000806084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0373  translation elongation factor G  54.45 
 
 		 704 aa  752    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000927424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  52.47 
 
 		 692 aa  731    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0451  elongation factor G  51.97 
 
 		 715 aa  714    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163293  unclonable  0.000000517484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4111  elongation factor G  51.23 
 
 		 703 aa  716    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0544  elongation factor G  76.4 
 
 		 694 aa  1129    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.372581  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  54.06 
 
 		 698 aa  757    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0016  elongation factor G  54.03 
 
 		 691 aa  770    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3022  elongation factor G  53.1 
 
 		 703 aa  737    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000530326  decreased coverage  0.00189636 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0875  elongation factor G  87.65 
 
 		 701 aa  1259    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.428812  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4765  translation elongation factor G  54.74 
 
 		 699 aa  743    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  53.26 
 
 		 691 aa  744    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1236  elongation factor G  55.39 
 
 		 694 aa  742    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0596578  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  53.31 
 
 		 698 aa  727    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0842  elongation factor G  84.7 
 
 		 697 aa  1228    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0623  translation elongation factor G  51.23 
 
 		 701 aa  702    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2635  elongation factor G  52.38 
 
 		 700 aa  733    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00747031  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  53.91 
 
 		 694 aa  759    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  53.77 
 
 		 694 aa  759    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4551  elongation factor G  51.66 
 
 		 701 aa  706    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0946111 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1895  elongation factor G  51.8 
 
 		 708 aa  734    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365208  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0316  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  52.17 
 
 		 697 aa  721    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000146619  hitchhiker  0.000265017 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  49.64 
 
 		 704 aa  704    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3183  elongation factor G  52.66 
 
 		 702 aa  735    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0250795  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0161  elongation factor G  53.9 
 
 		 690 aa  756    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.165931  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  53.54 
 
 		 696 aa  752    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1361  elongation factor G  54.93 
 
 		 690 aa  776    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  51.6 
 
 		 692 aa  708    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  52.38 
 
 		 700 aa  733    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  52.88 
 
 		 697 aa  754    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5082  elongation factor G  52.16 
 
 		 701 aa  720    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000061463  normal  0.350289 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1708  elongation factor G  53.47 
 
 		 705 aa  734    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  52.31 
 
 		 692 aa  738    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3444  elongation factor G  52.53 
 
 		 700 aa  731    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000177525  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  52.25 
 
 		 691 aa  719    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  50.94 
 
 		 691 aa  710    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  51.52 
 
 		 692 aa  724    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0292  translation elongation factor G  50.36 
 
 		 700 aa  702    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000300154  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0357  elongation factor G  51.72 
 
 		 696 aa  714    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  53.03 
 
 		 696 aa  736    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2691  elongation factor G  57.08 
 
 		 692 aa  790    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  53.14 
 
 		 692 aa  738    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  52.38 
 
 		 700 aa  733    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  53.12 
 
 		 697 aa  738    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  52.02 
 
 		 698 aa  729    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2292  elongation factor G  54.79 
 
 		 690 aa  772    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1246  elongation factor G  55.77 
 
 		 690 aa  781    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0961  elongation factor G  54.2 
 
 		 690 aa  761    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0577  elongation factor G  51.85 
 
 		 706 aa  717    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3798  elongation factor G  53.25 
 
 		 700 aa  737    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000136641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0928  elongation factor G  51.52 
 
 		 701 aa  708    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.082436  hitchhiker  0.00424173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0930  elongation factor G  84.38 
 
 		 697 aa  1213    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000763506  hitchhiker  0.00992492 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3451  elongation factor G  54.93 
 
 		 690 aa  776    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  53.84 
 
 		 697 aa  760    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  52.81 
 
 		 700 aa  747    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  52.46 
 
 		 700 aa  733    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0167  elongation factor G  52.45 
 
 		 698 aa  703    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000307195  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2958  elongation factor G  84.7 
 
 		 697 aa  1222    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000380689  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3187  elongation factor G  54.34 
 
 		 690 aa  770    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  51.5 
 
 		 706 aa  721    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1542  elongation factor G  54.64 
 
 		 690 aa  769    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2185  elongation factor G  52.09 
 
 		 708 aa  738    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00027976  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3325  elongation factor G  52.31 
 
 		 703 aa  733    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.888468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0494  translation elongation factor G  50.58 
 
 		 705 aa  707    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  50.22 
 
 		 697 aa  729    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0241  elongation factor G  53 
 
 		 706 aa  732    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449093  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2821  elongation factor G  55.2 
 
 		 697 aa  773    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.114421 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2762  elongation factor G  52.09 
 
 		 700 aa  731    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608809  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  52.09 
 
 		 701 aa  735    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0464  elongation factor G  100 
 
 		 695 aa  1426    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000919416  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0602  translation elongation factor G  54.24 
 
 		 701 aa  721    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000132615  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1681  elongation factor G  56.2 
 
 		 696 aa  774    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562102  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1645  elongation factor G  52.93 
 
 		 700 aa  720    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562984  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4509  elongation factor G  74.93 
 
 		 697 aa  1111    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  53.46 
 
 		 698 aa  731    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0698  elongation factor G  84.7 
 
 		 697 aa  1226    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000926499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  53.46 
 
 		 698 aa  731    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3324  elongation factor G  84.85 
 
 		 697 aa  1229    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000122235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0455  elongation factor G  53.61 
 
 		 699 aa  721    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  53.1 
 
 		 698 aa  727    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0550  elongation factor G  85.43 
 
 		 697 aa  1230    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000265126  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1798  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  55.05 
 
 		 691 aa  772    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.287581  normal  0.0715825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0264  elongation factor G  52.53 
 
 		 700 aa  731    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08820  elongation factor G  52.77 
 
 		 706 aa  723    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.569469  normal  0.0264606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37710  elongation factor G  52.46 
 
 		 702 aa  720    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2980  elongation factor G  52.65 
 
 		 713 aa  733    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0345  elongation factor G  52.24 
 
 		 700 aa  732    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  53.41 
 
 		 692 aa  735    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  53.46 
 
 		 698 aa  735    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3436  elongation factor G  84.7 
 
 		 697 aa  1231    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000032533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  52.44 
 
 		 700 aa  734    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  53.84 
 
 		 691 aa  749    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  52.24 
 
 		 692 aa  729    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0755  elongation factor G  54.15 
 
 		 707 aa  754    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  50.72 
 
 		 703 aa  719    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  53.82 
 
 		 698 aa  737    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0584  elongation factor G  82.61 
 
 		 696 aa  1205    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000111749  hitchhiker  0.000972187 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1004  elongation factor G  52.09 
 
 		 701 aa  735    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0357  elongation factor G  88.92 
 
 		 698 aa  1273    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.931415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  52.44 
 
 		 700 aa  728    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>