134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0336 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  100 
 
 		 412 aa  845    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  52.46 
 
 		 409 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  43.44 
 
 		 421 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  43.51 
 
 		 426 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  43.49 
 
 		 437 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  43.75 
 
 		 424 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  43.75 
 
 		 424 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  43.51 
 
 		 424 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  43.26 
 
 		 437 aa  289  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  43.51 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  43.87 
 
 		 420 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  43.99 
 
 		 424 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  44.71 
 
 		 407 aa  286  5.999999999999999e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  43.78 
 
 		 421 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  45.08 
 
 		 420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  42.92 
 
 		 419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  43.17 
 
 		 432 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  42.79 
 
 		 426 aa  283  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  43.54 
 
 		 421 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  43.22 
 
 		 440 aa  280  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  43.81 
 
 		 443 aa  279  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  43.94 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  42.99 
 
 		 437 aa  277  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  42.69 
 
 		 422 aa  276  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  44.34 
 
 		 434 aa  276  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  42.38 
 
 		 446 aa  276  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  43.13 
 
 		 429 aa  276  7e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  43.99 
 
 		 434 aa  275  8e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  41.65 
 
 		 418 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  45.58 
 
 		 428 aa  272  6e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  42.96 
 
 		 439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  42.25 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  40.87 
 
 		 424 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  41.59 
 
 		 440 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  39.29 
 
 		 428 aa  268  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  41.9 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  41.59 
 
 		 440 aa  266  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  39.29 
 
 		 448 aa  265  8.999999999999999e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  41.84 
 
 		 423 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  42.72 
 
 		 439 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  47.35 
 
 		 421 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  42.19 
 
 		 428 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  47.16 
 
 		 413 aa  261  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  44.23 
 
 		 424 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  41.88 
 
 		 447 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  41.72 
 
 		 448 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  41.82 
 
 		 446 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  43.56 
 
 		 437 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  41.97 
 
 		 421 aa  258  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  41.45 
 
 		 448 aa  257  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  42.49 
 
 		 439 aa  257  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  40 
 
 		 411 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  43.06 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  45.22 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1897  hydroxypyruvate reductase  42.08 
 
 		 438 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.216641 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  43.27 
 
 		 415 aa  253  5.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  42.22 
 
 		 432 aa  252  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  43.17 
 
 		 421 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  40.71 
 
 		 432 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  40.56 
 
 		 460 aa  252  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  37.53 
 
 		 404 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  45.98 
 
 		 419 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  41.83 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2031  hydroxypyruvate reductase  40.56 
 
 		 447 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560327 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  38.27 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2372  hydroxypyruvate reductase  45.83 
 
 		 424 aa  243  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.137273  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  38.27 
 
 		 417 aa  244  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  36.43 
 
 		 412 aa  244  3e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  43.87 
 
 		 435 aa  242  7.999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0659  hydroxypyruvate reductase  41.31 
 
 		 428 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  40.94 
 
 		 432 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2000  Hydroxypyruvate reductase  41.13 
 
 		 426 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  42.55 
 
 		 422 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  42.72 
 
 		 422 aa  238  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  42.9 
 
 		 424 aa  238  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  38.95 
 
 		 422 aa  236  5.0000000000000005e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  42.11 
 
 		 439 aa  235  8e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  41.88 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0566  hypothetical protein  41.37 
 
 		 428 aa  231  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7083  putative hydroxypyruvate reductase  42.86 
 
 		 426 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  40.32 
 
 		 374 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  38.77 
 
 		 450 aa  229  8e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0433  hydroxypyruvate reductase  42.9 
 
 		 424 aa  228  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  34.37 
 
 		 415 aa  223  4e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  39.46 
 
 		 443 aa  222  9e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  41.19 
 
 		 427 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  39.39 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0085  hydroxypyruvate reductase  35.89 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145768  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  39 
 
 		 496 aa  220  3.9999999999999997e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  37.41 
 
 		 452 aa  220  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  36.11 
 
 		 443 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  40.49 
 
 		 451 aa  216  5e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2421  Hydroxypyruvate reductase  38.02 
 
 		 454 aa  216  5e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  39.34 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3797  hydroxypyruvate reductase  40.77 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430898  normal  0.277754 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  43.13 
 
 		 317 aa  212  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3567  hydroxypyruvate reductase  40.94 
 
 		 426 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  0.669404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  37.12 
 
 		 428 aa  210  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3413  Hydroxypyruvate reductase  35.99 
 
 		 443 aa  209  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691767  normal  0.696405 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3071  putative hydroxypyruvate reductase/glycerate kinase  40.53 
 
 		 423 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>