More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0311 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00133  FhuE receptor  64.81 
 
 		 697 aa  931    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0311  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 697 aa  1414    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000107098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2549  TonB-dependent siderophore receptor  61.06 
 
 		 700 aa  875    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133657  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3277  TonB-dependent siderophore receptor  44.83 
 
 		 702 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.85101  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3929  TonB-dependent siderophore receptor  44.97 
 
 		 702 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  34.42 
 
 		 720 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1823  TonB-dependent siderophore receptor  37.44 
 
 		 696 aa  406  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.077851  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0540  TonB-dependent siderophore receptor  34.63 
 
 		 718 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  35.16 
 
 		 725 aa  399  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2724  FhuE receptor  35.67 
 
 		 707 aa  393  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3097  TonB-dependent siderophore receptor  33.61 
 
 		 723 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0603  TonB-dependent siderophore receptor  33.61 
 
 		 716 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00298801  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3717  TonB-dependent siderophore receptor  32.36 
 
 		 726 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2798  TonB-dependent receptor  33.99 
 
 		 686 aa  368  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000816891  hitchhiker  0.0000136093 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  34.06 
 
 		 731 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  33.51 
 
 		 729 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3064  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 712 aa  357  5e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  33.47 
 
 		 723 aa  355  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  32.9 
 
 		 693 aa  346  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 		 693 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  32.45 
 
 		 733 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  33.73 
 
 		 722 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  34.03 
 
 		 722 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2339  TonB-dependent siderophore receptor  33.88 
 
 		 722 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000312883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 		 696 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.79 
 
 		 747 aa  328  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  32.55 
 
 		 737 aa  321  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.82 
 
 		 729 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  29.82 
 
 		 729 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.82 
 
 		 729 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.82 
 
 		 729 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.82 
 
 		 729 aa  320  7.999999999999999e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.82 
 
 		 729 aa  320  7.999999999999999e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 		 729 aa  319  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.82 
 
 		 729 aa  319  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  32.13 
 
 		 741 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  32.27 
 
 		 741 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.96 
 
 		 724 aa  317  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.81 
 
 		 724 aa  317  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.81 
 
 		 724 aa  316  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.66 
 
 		 724 aa  316  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  31.87 
 
 		 747 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.51 
 
 		 724 aa  313  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 		 747 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.01 
 
 		 729 aa  313  9e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 		 714 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  31.87 
 
 		 840 aa  306  9.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.45 
 
 		 728 aa  305  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  31.92 
 
 		 723 aa  304  4.0000000000000003e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 		 803 aa  303  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  31.14 
 
 		 735 aa  302  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0106  TonB-dependent siderophore receptor  30.51 
 
 		 728 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1507  TonB-dependent siderophore receptor  33.08 
 
 		 737 aa  300  6e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.681157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  31.6 
 
 		 816 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  31.43 
 
 		 815 aa  299  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  30.81 
 
 		 723 aa  299  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4426  TonB-dependent siderophore receptor  30.33 
 
 		 728 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3033  ferric alcaligin siderophore receptor  32.78 
 
 		 700 aa  295  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0114  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 728 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4286  TonB-dependent siderophore receptor  30.05 
 
 		 728 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1451  TonB-dependent siderophore receptor  32.63 
 
 		 737 aa  293  9e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 		 814 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0137  TonB-dependent iron-siderophore receptor precursor  31.2 
 
 		 721 aa  291  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1517  TonB-dependent siderophore receptor  32.34 
 
 		 737 aa  291  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134645  normal  0.877607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  31.13 
 
 		 803 aa  289  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 		 730 aa  287  4e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 827 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  30.51 
 
 		 740 aa  283  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  29.77 
 
 		 799 aa  277  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  30.42 
 
 		 732 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  29.39 
 
 		 766 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  29.97 
 
 		 808 aa  273  7e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  29.01 
 
 		 802 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  28.68 
 
 		 753 aa  266  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  29.53 
 
 		 819 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 		 748 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 741 aa  265  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  28.68 
 
 		 753 aa  264  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 802 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  29.4 
 
 		 840 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 806 aa  261  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1999  outer membrane receptor for Fe  28.89 
 
 		 706 aa  259  9e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.928723  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  28.22 
 
 		 812 aa  257  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 		 817 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 795 aa  255  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.92 
 
 		 825 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  30.14 
 
 		 810 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 798 aa  252  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  29.07 
 
 		 822 aa  252  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 		 722 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  28.07 
 
 		 807 aa  250  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  28.36 
 
 		 789 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  30.72 
 
 		 803 aa  247  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 765 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 765 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 765 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2000  outer membrane receptor for Fe  28.74 
 
 		 706 aa  244  3e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 		 801 aa  244  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 821 aa  243  9e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0873  outer membrane receptor for Fe  27.15 
 
 		 712 aa  243  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.474088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>