234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0242 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0242  fructose-1,6-bisphosphatase  100 
 
 
323 aa  671  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0389611  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00214  fructose-1,6-bisphosphatase  86.25 
 
 
325 aa  579  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4614  fructose-1,6-bisphosphatase  67.91 
 
 
322 aa  466  1e-130  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3991  fructose-1,6-bisphosphatase  60.75 
 
 
325 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0773  fructose-1,6-bisphosphatase  59.81 
 
 
329 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  1.38522e-07  normal  0.0106002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0531  fructose-1,6-bisphosphatase  61.37 
 
 
330 aa  388  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.012262  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3663  fructose-1,6-bisphosphatase  60.75 
 
 
325 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0199188  hitchhiker  8.25139e-06 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3770  fructose-1,6-bisphosphatase  59.81 
 
 
329 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.61659e-07  hitchhiker  0.001107 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0813  fructose-1,6-bisphosphatase  60.12 
 
 
329 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.66321e-06  hitchhiker  0.000279081 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0784  fructose-1,6-bisphosphatase  60.12 
 
 
342 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0298171  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0731  fructose-1,6-bisphosphatase  60.75 
 
 
329 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.93174e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0676  fructose-1,6-bisphosphatase  60.44 
 
 
330 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  4.49089e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3844  fructose-1,6-bisphosphatase  60.75 
 
 
325 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0810382  unclonable  9.76669e-06 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0599  fructose-1,6-bisphosphatase  60.12 
 
 
320 aa  386  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.76806e-08  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3721  fructose-1,6-bisphosphatase  60.12 
 
 
330 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10391  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2986  fructose-1,6-bisphosphatase  60.44 
 
 
330 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3373  fructose-1,6-bisphosphatase  59.81 
 
 
330 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.87487e-06  hitchhiker  0.00208925 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0648  fructose-1,6-bisphosphatase  60.12 
 
 
330 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  6.05795e-06  hitchhiker  6.05277e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0649  fructose-1,6-bisphosphatase  59.81 
 
 
330 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  1.2106e-05  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1495  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  55.14 
 
 
337 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  6.16027e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5090  fructose-1,6-bisphosphatase  55.49 
 
 
336 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2381  fructose-1,6-bisphosphatase  56.07 
 
 
337 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.881144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0423  fructose-1,6-bisphosphatase  55.18 
 
 
336 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4914  fructose-1,6-bisphosphatase  54.88 
 
 
336 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03469  fructose-1,6-bisphosphatase  57.28 
 
 
336 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5168  fructose-1,6-bisphosphatase  54.88 
 
 
336 aa  371  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0875  fructose-1,6-bisphosphatase  57.1 
 
 
338 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0821253  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0370  fructose-1,6-bisphosphatase  55.02 
 
 
336 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0352  fructose-1,6-bisphosphatase  54.88 
 
 
336 aa  371  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4125  fructose-1,6-bisphosphatase  54.97 
 
 
337 aa  371  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00362057  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5040  fructose-1,6-bisphosphatase  54.88 
 
 
336 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0973  fructose-1,6-bisphosphatase  55.45 
 
 
337 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798772  normal  0.126092 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0877  fructose-1,6-bisphosphatase  55.45 
 
 
339 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798323  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0889  fructose-1,6-bisphosphatase  55.76 
 
 
339 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138169  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1149  fructose-1,6-bisphosphatase  56.87 
 
 
335 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191646  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2126  fructose-1,6-bisphosphatase  53.31 
 
 
338 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1014  fructose-1,6-bisphosphatase  55.14 
 
 
337 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0535  fructose-1,6-bisphosphatase  55.14 
 
 
337 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115593  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2266  fructose-1,6-bisphosphatase  52.87 
 
 
338 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.014374  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1943  fructose-1,6-bisphosphatase  53.47 
 
 
338 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.713905  normal  0.0350228 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0990  fructose-1,6-bisphosphatase  54.66 
 
 
338 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2925  fructose-1,6-bisphosphatase  54.66 
 
 
338 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2987  fructose-1,6-bisphosphatase  54.66 
 
 
338 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0157  fructose-1,6-bisphosphatase  54.66 
 
 
338 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2618  fructose-1,6-bisphosphatase  54.66 
 
 
338 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.36  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3031  fructose-1,6-bisphosphatase  54.66 
 
 
338 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0469  fructose-1,6-bisphosphatase  54.66 
 
 
338 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3795  fructose-1,6-bisphosphatase  53.7 
 
 
337 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2444  fructose-1,6-bisphosphatase  56.31 
 
 
339 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1604  fructose-1,6-bisphosphatase  54.66 
 
 
338 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0685  fructose-1,6-bisphosphatase  53.25 
 
 
338 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3071  fructose-1,6-bisphosphatase  53.25 
 
 
338 aa  364  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137108  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0508  fructose-1,6-bisphosphatase  54.57 
 
 
335 aa  364  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0020  fructose-1,6-bisphosphatase  53.4 
 
 
338 aa  363  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  6.87853e-08 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1843  fructose-1,6-bisphosphatase  53.09 
 
 
335 aa  363  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0532341  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0281  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  55.08 
 
 
336 aa  362  4e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3263  fructose-1,6-bisphosphatase  53.09 
 
 
335 aa  362  4e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139597  hitchhiker  8.37949e-09 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5843  fructose-1,6-bisphosphatase  53.66 
 
 
336 aa  362  5e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45640  fructose-1,6-bisphosphatase  54.13 
 
 
337 aa  362  5e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67490  fructose-1,6-bisphosphatase  53.52 
 
 
336 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309201  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2704  fructose-1,6-bisphosphatase  53.27 
 
 
334 aa  359  4e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0084  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  53.25 
 
 
337 aa  358  5e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0920  fructose-1,6-bisphosphatase  52.63 
 
 
338 aa  358  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.701252  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1067  fructose-1,6-bisphosphatase  52.78 
 
 
335 aa  357  1e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.641395  normal  0.908963 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2577  fructose-1,6-bisphosphatase  54.83 
 
 
337 aa  357  1e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.157967 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1763  fructose-1,6-bisphosphatase  52.8 
 
 
341 aa  356  3e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106936 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4138  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  55.11 
 
 
319 aa  355  5e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  2.56898e-08  unclonable  5.22982e-12 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1586  fructose-1,6-bisphosphatase  52.65 
 
 
335 aa  355  6e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2250  fructose-1,6-bisphosphatase  53.29 
 
 
339 aa  354  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.523394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2760  fructose-1,6-bisphosphatase  52.98 
 
 
339 aa  353  3e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1859  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  54.02 
 
 
334 aa  351  7e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  1.01477e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0368  fructose-1,6-bisphosphatase  53.97 
 
 
339 aa  351  9e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.244889  normal  0.233864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0189  fructose-1,6-bisphosphatase  53.97 
 
 
339 aa  351  9e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0209227  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2775  fructose-1,6-bisphosphatase  50.93 
 
 
336 aa  350  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0021  fructose-1,6-bisphosphatase  54.22 
 
 
335 aa  347  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193201  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1278  D-fructose 1,6-bisphosphatase  54.69 
 
 
322 aa  347  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  4.38051e-08  normal  0.25369 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2319  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  53.14 
 
 
338 aa  343  2e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.514677  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1409  fructose-1,6-bisphosphatase  52.9 
 
 
333 aa  340  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3589  D-fructose 1,6-bisphosphatase  54.6 
 
 
338 aa  339  5e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0270544 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3628  fructose-1,6-bisphosphatase  54.69 
 
 
357 aa  333  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3283  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  49.85 
 
 
343 aa  332  5e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0669  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  49.84 
 
 
335 aa  323  3e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2450  fructose-1,6-bisphosphatase  51.88 
 
 
378 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709501  normal  0.535256 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1982  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  52.35 
 
 
364 aa  322  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0586  D-fructose 1,6-bisphosphatase  51.96 
 
 
331 aa  321  1e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  3.25166e-05  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1187  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  49.36 
 
 
339 aa  318  6e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2788  D-fructose 1,6-bisphosphatase  49.07 
 
 
357 aa  317  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450037  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3026  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  48.76 
 
 
358 aa  316  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00242569  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3013  fructose-1,6-bisphosphatase  53.36 
 
 
322 aa  315  5e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514687  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1393  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  49.84 
 
 
364 aa  311  7e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834199  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1857  fructose-1,6-bisphosphatase  50.98 
 
 
334 aa  309  4e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  2.62461e-10  hitchhiker  0.000253993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3755  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  50.15 
 
 
365 aa  308  9e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2636  D-fructose 1,6-bisphosphatase  48.61 
 
 
333 aa  306  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0412723  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1511  D-fructose 1,6-bisphosphatase  50.62 
 
 
365 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  4.22669e-08  decreased coverage  8.00022e-05 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2403  D-fructose 1,6-bisphosphatase  48.39 
 
 
369 aa  306  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96213  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0541  fructose-1,6-bisphosphatase  50.79 
 
 
327 aa  305  7e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0530  fructose-1,6-bisphosphatase  52.26 
 
 
327 aa  298  1e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.059521  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1481  D-fructose 1,6-bisphosphatase  51.71 
 
 
351 aa  292  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1915  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  46.79 
 
 
371 aa  285  6e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.934073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0919  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  47.26 
 
 
348 aa  283  3e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.547714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>