More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0209 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 244 aa  495  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  62.08 
 
 		 243 aa  281  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  46.47 
 
 		 265 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  49.18 
 
 		 254 aa  218  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.92 
 
 		 247 aa  214  9e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  40.43 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  39.13 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 245 aa  145  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  37 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 245 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.99 
 
 		 237 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 		 233 aa  129  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  36.28 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  33.62 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 		 234 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  35.84 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  32.6 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  34.91 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  34.67 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  32.6 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  34.91 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  32.04 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104801  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  37 
 
 		 234 aa  99.4  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1223  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.38 
 
 		 272 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1049  short chain dehydrogenase  31.38 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  33.77 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  34.53 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 		 255 aa  95.5  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 		 261 aa  95.1  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 		 264 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1696  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.77 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.817291  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 		 250 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  38.33 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  37.78 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  37.78 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  37.78 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  37.78 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 		 303 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 		 291 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  37.78 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0373  Short-chain alcohol dehydrogenase  35.03 
 
 		 243 aa  93.2  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  30.37 
 
 		 286 aa  92.8  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6694  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 		 242 aa  92.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.43 
 
 		 232 aa  92.8  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1018  short chain dehydrogenase  30.81 
 
 		 298 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176999  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 		 293 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 		 255 aa  92.4  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.87 
 
 		 276 aa  92  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 249 aa  91.7  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 242 aa  91.7  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 246 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.83 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.15353 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.81 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4937  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.43 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  32.97 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.31 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  35.57 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0945  short chain dehydrogenase  32.63 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 		 289 aa  90.1  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 252 aa  89.4  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.06 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 234 aa  89.7  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 		 257 aa  89.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1837  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00311801  normal  0.334735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0663055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.33 
 
 		 231 aa  89  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.33 
 
 		 231 aa  89  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 		 217 aa  89  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 		 272 aa  89  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 262 aa  89  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.94 
 
 		 250 aa  89  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 		 290 aa  89  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  31.9 
 
 		 263 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  31.9 
 
 		 263 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>