23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0206 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0206  hypothetical protein  100 
 
 		 580 aa  1209    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  43.06 
 
 		 572 aa  513  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1824  hypothetical protein  43.96 
 
 		 582 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000311233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2356  hypothetical protein  42.58 
 
 		 578 aa  474  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1782  hypothetical protein  27.33 
 
 		 536 aa  174  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432759 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1963  hypothetical protein  25.99 
 
 		 534 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1749  hypothetical protein  25.99 
 
 		 534 aa  168  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000314791  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1974  conserved hypothetical protein  25.99 
 
 		 534 aa  166  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000437192  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01627  hypothetical protein  25.99 
 
 		 534 aa  166  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373231  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01637  conserved protein with FAD/NAD(P)-binding domain  25.99 
 
 		 534 aa  166  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.395296  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2381  hypothetical protein  25.78 
 
 		 534 aa  163  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000071971  hitchhiker  0.00180659 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3875  hypothetical protein  25.89 
 
 		 534 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.408121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3137  hypothetical protein  25.68 
 
 		 534 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  20.71 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  20.71 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  26.81 
 
 		 506 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  19.44 
 
 		 494 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  24.49 
 
 		 742 aa  52  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  21.58 
 
 		 615 aa  49.7  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  25.96 
 
 		 469 aa  47.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  23.28 
 
 		 475 aa  45.8  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  25.53 
 
 		 469 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  26.63 
 
 		 651 aa  44.3  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>