260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0204 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  100 
 
 		 425 aa  845    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  39.33 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 417 aa  229  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  33.58 
 
 		 418 aa  223  6e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 427 aa  223  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  33.58 
 
 		 418 aa  222  9e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 429 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 409 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  40.17 
 
 		 443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 436 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  31.84 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  32.43 
 
 		 412 aa  210  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  34.01 
 
 		 411 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 432 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 415 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 432 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  31.93 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 412 aa  199  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 430 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  31.51 
 
 		 397 aa  186  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  32.73 
 
 		 427 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 433 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 416 aa  183  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 429 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 417 aa  180  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 431 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 433 aa  179  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  35.33 
 
 		 471 aa  178  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  34.91 
 
 		 429 aa  173  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  36.1 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  31.54 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 452 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  32.74 
 
 		 429 aa  171  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 432 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  32.48 
 
 		 404 aa  169  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  35.55 
 
 		 520 aa  169  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 418 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  31.97 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 446 aa  166  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  28.89 
 
 		 444 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 443 aa  163  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 443 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 444 aa  162  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 471 aa  162  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  28.6 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  29.45 
 
 		 465 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  28.76 
 
 		 398 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 424 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  27.81 
 
 		 412 aa  155  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 408 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  29.64 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  29.03 
 
 		 407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0467  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 439 aa  153  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.677382 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3325  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  29.17 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  33.68 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 436 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 459 aa  149  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 474 aa  149  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 476 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  33.53 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  29.45 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  32.72 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 480 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 480 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  33.15 
 
 		 438 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 476 aa  147  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  28.47 
 
 		 434 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 474 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  29.17 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  28.4 
 
 		 434 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 480 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 481 aa  144  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  28.84 
 
 		 726 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4270  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 390 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 713 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0101  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0689  transport protein of the major facilitator  29.32 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 444 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  32.95 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0691  hypothetical protein  29.04 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.256683  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3577  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0452  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>