More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0190 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  66.88 
 
 		 482 aa  654    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  66.81 
 
 		 481 aa  678    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4091  tldD protein  67.92 
 
 		 482 aa  636    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  65.48 
 
 		 481 aa  645    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  67.71 
 
 		 493 aa  648    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  67.37 
 
 		 481 aa  642    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  74.38 
 
 		 490 aa  759    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  68.55 
 
 		 482 aa  650    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  67.3 
 
 		 482 aa  643    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  68.55 
 
 		 497 aa  654    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  66.32 
 
 		 481 aa  645    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 480 aa  987    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  67.71 
 
 		 482 aa  634    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0876014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  66.53 
 
 		 481 aa  654    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  68.55 
 
 		 497 aa  654    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  68.76 
 
 		 497 aa  656    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  68.97 
 
 		 482 aa  658    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  66.32 
 
 		 481 aa  631  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  66.32 
 
 		 481 aa  631  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  66.32 
 
 		 481 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  66.32 
 
 		 481 aa  631  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  66.53 
 
 		 481 aa  632  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3681  protease TldD  66.11 
 
 		 481 aa  634  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  66.32 
 
 		 481 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  66.32 
 
 		 481 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  66.32 
 
 		 481 aa  631  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  67.71 
 
 		 482 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  67.71 
 
 		 482 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  66.32 
 
 		 481 aa  631  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  67.71 
 
 		 482 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  61.89 
 
 		 481 aa  632  1e-180  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  66.32 
 
 		 481 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  66.32 
 
 		 481 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  66.32 
 
 		 481 aa  631  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  65.9 
 
 		 481 aa  632  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  66.32 
 
 		 481 aa  631  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002390  TldD protein probably a protease  66.32 
 
 		 481 aa  631  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  67.51 
 
 		 482 aa  634  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  65.48 
 
 		 481 aa  628  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  65.69 
 
 		 481 aa  627  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  67.51 
 
 		 481 aa  630  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  65.69 
 
 		 481 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  65.69 
 
 		 481 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  66.88 
 
 		 482 aa  625  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  65.9 
 
 		 481 aa  627  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  66.46 
 
 		 490 aa  624  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  66.46 
 
 		 481 aa  624  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  64.03 
 
 		 479 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0276  microcin-processing peptidase 2  60.17 
 
 		 482 aa  598  1e-169  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  63.9 
 
 		 480 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  64.21 
 
 		 480 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  62.63 
 
 		 480 aa  588  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  63.05 
 
 		 479 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  63.26 
 
 		 479 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  63.05 
 
 		 479 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  60.47 
 
 		 480 aa  586  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  60.55 
 
 		 480 aa  587  1e-166  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  62.84 
 
 		 479 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  62.68 
 
 		 481 aa  587  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  59.96 
 
 		 483 aa  586  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.04 
 
 		 481 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.75 
 
 		 486 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  60.72 
 
 		 484 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  60.97 
 
 		 486 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  63.2 
 
 		 479 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  59.87 
 
 		 481 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  62.63 
 
 		 481 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.59 
 
 		 481 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.95 
 
 		 496 aa  574  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  60.25 
 
 		 481 aa  570  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1778  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  57.59 
 
 		 496 aa  568  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.42 
 
 		 487 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  63.28 
 
 		 480 aa  567  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0412  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.79 
 
 		 485 aa  565  1e-160  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.140999  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0472  TldD protein  60.58 
 
 		 485 aa  565  1e-160  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0623925  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  65.1 
 
 		 480 aa  563  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2490  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.38 
 
 		 487 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2956  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.66 
 
 		 486 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1496  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  56.96 
 
 		 496 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.768084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1487  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.03 
 
 		 486 aa  559  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  58.46 
 
 		 486 aa  560  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  60.55 
 
 		 490 aa  560  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.7 
 
 		 486 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  59.75 
 
 		 498 aa  557  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3972  microcin-processing peptidase 2  58.87 
 
 		 488 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0991  microcin-processing peptidase 2  59.54 
 
 		 486 aa  557  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  57.41 
 
 		 508 aa  553  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0850  microcin-processing peptidase 2  59.38 
 
 		 486 aa  554  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140051 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0939  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.3 
 
 		 487 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.37 
 
 		 488 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  57.72 
 
 		 491 aa  553  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0726  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.25 
 
 		 488 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.571248 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  57.14 
 
 		 490 aa  548  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  56.55 
 
 		 477 aa  545  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0512  putative modulator of DNA gyrase  59.37 
 
 		 490 aa  544  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2645  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.42 
 
 		 488 aa  541  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  56.43 
 
 		 477 aa  543  1e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0657  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.21 
 
 		 488 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2218  TldD/PmbA family protein  58.51 
 
 		 498 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.762939  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.19 
 
 		 481 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>