181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0119 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 425 aa  846    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  75.13 
 
 		 389 aa  594  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  72.42 
 
 		 428 aa  589  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  62.53 
 
 		 412 aa  481  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  63.28 
 
 		 413 aa  478  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  53.75 
 
 		 415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  53.49 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  54.16 
 
 		 420 aa  439  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  55.47 
 
 		 424 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  53.71 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  52.58 
 
 		 410 aa  430  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  51.2 
 
 		 436 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  52.59 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  52.36 
 
 		 423 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  52.12 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  52.12 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  52.36 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  52.12 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  52.12 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  53.45 
 
 		 407 aa  422  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  53.3 
 
 		 423 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  51.56 
 
 		 415 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  52.27 
 
 		 421 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  50.23 
 
 		 435 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  51.84 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  51.32 
 
 		 421 aa  414  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  49.88 
 
 		 431 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  50.82 
 
 		 428 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  50.12 
 
 		 431 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  49.41 
 
 		 431 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  48.91 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  50.6 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  49.64 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  50 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  50.5 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  51.18 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  46.04 
 
 		 426 aa  359  5e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  46.19 
 
 		 440 aa  354  1e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  45.08 
 
 		 426 aa  349  6e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  41.61 
 
 		 468 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  42.07 
 
 		 471 aa  318  9e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  44.14 
 
 		 428 aa  311  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  42.96 
 
 		 412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  41.58 
 
 		 413 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  43.51 
 
 		 429 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  39.92 
 
 		 485 aa  291  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  43.5 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  43.83 
 
 		 408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  43.58 
 
 		 408 aa  282  1e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  39.51 
 
 		 417 aa  280  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  39.25 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  38.54 
 
 		 417 aa  277  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  39.51 
 
 		 405 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  37.1 
 
 		 432 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  38.8 
 
 		 417 aa  269  8e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  37.8 
 
 		 431 aa  254  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  38.19 
 
 		 439 aa  250  4e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  34.94 
 
 		 409 aa  240  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  32.63 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  35.8 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  33.72 
 
 		 434 aa  220  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  34.49 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  35.19 
 
 		 433 aa  216  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  33.33 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  33.8 
 
 		 438 aa  213  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  33.8 
 
 		 438 aa  213  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  33.8 
 
 		 438 aa  213  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  33.8 
 
 		 438 aa  213  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  33.58 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  33.8 
 
 		 438 aa  212  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  34.12 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  34.12 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  34.12 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  34.12 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  34.12 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  34.22 
 
 		 438 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  35.41 
 
 		 399 aa  209  6e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  31.25 
 
 		 420 aa  209  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  31.06 
 
 		 412 aa  209  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  33.5 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  38.29 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  33.5 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  31.41 
 
 		 413 aa  203  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  31.22 
 
 		 443 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  32.08 
 
 		 417 aa  202  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  32.54 
 
 		 444 aa  203  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  34.52 
 
 		 426 aa  202  9e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  32.19 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  33.42 
 
 		 468 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  32.59 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  31.73 
 
 		 414 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  32.03 
 
 		 457 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  32.03 
 
 		 457 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  31.75 
 
 		 457 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  31.13 
 
 		 457 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4565  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 488 aa  192  9e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  32.82 
 
 		 429 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  32.37 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  30.67 
 
 		 446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  31.73 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>