More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0101 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0101  OsmC-like protein  100 
 
 		 142 aa  287  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03141  putative organic hydroperoxide resistance protein  67.38 
 
 		 142 aa  196  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.499234  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2080  OsmC family protein  63.04 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.378208 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1107  organic hydroperoxide resistance protein  60.43 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03888  organic hydroperoxide resistance protein  63.12 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1195  OsmC family protein  64.08 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4272  OsmC family protein  60.28 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0619727  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0473  OsmC family protein  60.28 
 
 		 138 aa  174  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0482  OsmC family protein  60.28 
 
 		 138 aa  174  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0376835 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3098  OsmC family protein  59.71 
 
 		 141 aa  173  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3445  OsmC family protein  59.71 
 
 		 141 aa  173  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0058  putative organic hydroperoxide resistance protein  64.08 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0897  OsmC family protein  58.99 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0224  OsmC family protein  58.7 
 
 		 141 aa  169  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2630  OsmC family protein  58.27 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0518  OsmC family protein  59.71 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582796 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0520  OsmC family protein  58.99 
 
 		 141 aa  167  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.942012  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4590  OsmC-like protein  58.27 
 
 		 141 aa  167  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0622  OsmC-like protein  59.86 
 
 		 141 aa  167  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0377  OsmC-like protein  62.22 
 
 		 141 aa  167  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1859  OsmC family protein  60.9 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3618  organic hydroperoxide resistance protein OhrB  60.43 
 
 		 140 aa  166  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1354  OsmC family protein  58.27 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0402  OsmC family protein  57.55 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1434  OsmC family protein  61.65 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5559  OsmC-like protein  58.27 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3855  OsmC family protein  60.9 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0700851  normal  0.118615 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1067  OsmC family protein  61.59 
 
 		 141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0574  OsmC-like protein  57.25 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1469  OsmC family protein  60.15 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1329  peroxiredoxin, Ohr subfamily  54.68 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4765  OsmC family protein  61.59 
 
 		 141 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.273761  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2232  OsmC-like protein  57.97 
 
 		 139 aa  161  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22057  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2195  Ohr  55.63 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365953  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3627  OsmC-like protein  62.41 
 
 		 139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000186572  normal  0.0859541 
 
 
 
NC_012917  PC1_2949  OsmC family protein  54.68 
 
 		 141 aa  160  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5955  OsmC family protein  55.4 
 
 		 141 aa  160  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  normal  0.500697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0819  OsmC family protein  58.52 
 
 		 140 aa  160  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0302641  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0130  OsmC family protein  57.25 
 
 		 141 aa  159  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4255  OsmC family protein  61.59 
 
 		 141 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.97654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1642  peroxiredoxin, Ohr subfamily  58.99 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2250  OsmC family protein  57.97 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316574  normal  0.393622 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0885  organic hydroperoxide resistance protein  56.2 
 
 		 140 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1767  organic hydroperoxide resistance protein  61.65 
 
 		 139 aa  158  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3761  OsmC family protein  56.52 
 
 		 139 aa  158  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  hitchhiker  0.00132961 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3232  OsmC family protein  56.52 
 
 		 139 aa  158  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3292  OsmC family protein  57.66 
 
 		 140 aa  158  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.274194  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4500  OsmC-like protein  55.8 
 
 		 139 aa  157  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3864  OsmC family protein  55.8 
 
 		 139 aa  157  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0291901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3663  OsmC family protein  55.8 
 
 		 139 aa  157  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367985  normal  0.784642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3997  OsmC-like protein  59.4 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000925834  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4881  OsmC family protein  54.35 
 
 		 139 aa  154  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225177  hitchhiker  0.00150856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27220  organic hydroperoxide resistance protein  63.16 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6064  OsmC family protein  55.4 
 
 		 141 aa  153  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0829  organic hydroperoxide resistance protein  54.01 
 
 		 140 aa  153  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0927  OsmC family protein  55.47 
 
 		 140 aa  153  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595289  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5683  OsmC family protein  58.99 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.093671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5124  OsmC-like protein  52.11 
 
 		 138 aa  152  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0814  OsmC family protein  54.74 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.245539  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4967  OsmC family protein  56.43 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2423  organic hydroperoxide resistance protein  54.74 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0863  organic hydroperoxide resistance protein  54.74 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188106  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7670  OsmC-like protein  55.4 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.470182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2560  hypothetical protein  54.74 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0422  OsmC family protein  55.56 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0577  OsmC family protein  56.93 
 
 		 140 aa  150  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5713  OsmC family protein  54.68 
 
 		 141 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.295577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5771  OsmC-like protein  55.4 
 
 		 141 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6618  OsmC family protein  55.4 
 
 		 141 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0787465 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6136  OsmC family protein  55.4 
 
 		 141 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1482  organic hydroperoxide resistance protein  54.01 
 
 		 139 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1937  peroxiredoxin, Ohr subfamily  55.15 
 
 		 142 aa  150  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0303  organic hydroperoxide resistance protein  54.01 
 
 		 139 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0597  organic hydroperoxide resistance protein  54.74 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0109  organic hydroperoxide resistance protein  60.87 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0933  OsmC family protein  58.39 
 
 		 141 aa  148  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.015956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4428  OsmC family protein  51.05 
 
 		 139 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.49073  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1196  organic hydroperoxide resistance protein  56.34 
 
 		 143 aa  148  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.380059  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1104  OsmC family protein  56.34 
 
 		 143 aa  147  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5602  OsmC family protein  55.4 
 
 		 141 aa  148  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0334  organic hydroperoxide resistance protein  53.28 
 
 		 139 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.782303  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1678  organic hydroperoxide resistance protein  53.28 
 
 		 139 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638789  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15290  organic hydroperoxide resistance protein (OsmC family)  58.65 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.043985  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3619  OsmC family protein  48.92 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108059  hitchhiker  0.0000417493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2206  OsmC-like protein  54.93 
 
 		 150 aa  146  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4882  OsmC-like protein  50 
 
 		 139 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000261871  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1612  OsmC family protein  49.65 
 
 		 139 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2464  OsmC-like protein  50 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3253  organic hydroperoxide resistance protein  51.45 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.434532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  56.3 
 
 		 140 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1223  OsmC-like protein  50 
 
 		 139 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20817  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  56.3 
 
 		 140 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1702  OsmC family protein  50 
 
 		 139 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  56.3 
 
 		 140 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1190  organic hydroperoxide resistance protein  53.28 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.481185  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1635  OsmC family protein  48.95 
 
 		 139 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2711  OsmC family protein  57.66 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2049  OsmC family protein  49.3 
 
 		 138 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.296656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6798  OsmC family protein  53.28 
 
 		 139 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354891  decreased coverage  0.0000000499481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2843  organic hydroperoxide resistance protein  53.28 
 
 		 139 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151375  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>