More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0100 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0100  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  286  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03142  putative OhrR transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  53.38 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.946678  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 165 aa  111  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 165 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 165 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  42.74 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  40.77 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 165 aa  104  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  42.37 
 
 		 143 aa  103  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  39.55 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  39.17 
 
 		 154 aa  103  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  44 
 
 		 155 aa  103  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  39.17 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  39.17 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  38.94 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  42.37 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  41.53 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 155 aa  100  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  38.05 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  40.71 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  40.87 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  41.23 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  37.17 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  37.17 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  40.87 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  37.17 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  40.87 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 151 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  42.15 
 
 		 153 aa  97.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 152 aa  97.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 		 157 aa  97.1  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 170 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  38.05 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 		 166 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  38.6 
 
 		 157 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  38.39 
 
 		 149 aa  93.6  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  38.39 
 
 		 149 aa  93.6  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 169 aa  93.6  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  39.64 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3365  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 161 aa  92  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 151 aa  92.8  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  38.79 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2621  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276728  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  35.11 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  33.57 
 
 		 167 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  37.72 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 185 aa  90.5  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  36.84 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36.43 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  38.74 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 160 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 161 aa  88.6  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0840  transcriptional regulator, MarR family  37.39 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  37.19 
 
 		 162 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  34.11 
 
 		 146 aa  87  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 155 aa  87  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 153 aa  87  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>