297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0095 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0095  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  100 
 
 		 372 aa  770    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3262  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.55 
 
 		 309 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.562048  normal  0.487952 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1902  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.04 
 
 		 747 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310197  hitchhiker  0.00633735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2633  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.79 
 
 		 338 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0344  ribonucleoside hydrolase RihC  32.71 
 
 		 315 aa  109  8.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2587  ribosylpyrimidine nucleosidase  33.33 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3042  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.26 
 
 		 341 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0319  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  32.11 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182819 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  31.8 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  30.3 
 
 		 310 aa  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2350  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.44 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.987323  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2308  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.44 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.287385  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  29.83 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  29.83 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2117  Ribosylpyrimidine nucleosidase  30.28 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4422  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.99 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  30.69 
 
 		 318 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  33.47 
 
 		 313 aa  99.8  7e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4446  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.77 
 
 		 311 aa  99.8  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.1 
 
 		 311 aa  99.8  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4396  purine nucleosidase  31.29 
 
 		 314 aa  99.4  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0624  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.78 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  31.08 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0564  Ribosylpyrimidine nucleosidase  30.68 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  30.32 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2450  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  30.27 
 
 		 441 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.67 
 
 		 315 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  30.32 
 
 		 318 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1256  IUNH family nucleoside hydrolase  30.95 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1182  IUNH family nucleoside hydrolase  30.27 
 
 		 441 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0672  ribonucleoside hydrolase 1  31.15 
 
 		 311 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0598  ribonucleoside hydrolase 1  31.15 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0743  ribonucleoside hydrolase 1  31.15 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00617  ribonucleoside hydrolase 1  31.15 
 
 		 311 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2975  Purine nucleosidase  31.15 
 
 		 311 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4938  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.36 
 
 		 307 aa  97.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.35183  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0185  Purine nucleosidase  32.48 
 
 		 355 aa  97.1  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00606  hypothetical protein  31.15 
 
 		 311 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0778  ribonucleoside hydrolase 1  30.74 
 
 		 311 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3770  ribonucleoside hydrolase 1  29.96 
 
 		 318 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0704  ribonucleoside hydrolase 1  30.33 
 
 		 311 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13427  nucleoside hydrolase iunH (purine nucleosidase)  30.41 
 
 		 308 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00808696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  31.15 
 
 		 311 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  31.15 
 
 		 311 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0814  ribonucleoside hydrolase 1  30.33 
 
 		 311 aa  96.3  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0765  ribonucleoside hydrolase 1  30.33 
 
 		 311 aa  96.3  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0647  ribonucleoside hydrolase 1  31.33 
 
 		 318 aa  96.3  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1071  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.01 
 
 		 315 aa  95.9  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  30.74 
 
 		 311 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  29.35 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1555  hypothetical protein  29.35 
 
 		 379 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3306  ribonucleoside hydrolase 1  31.33 
 
 		 318 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3476  ribonucleoside hydrolase 1  31.33 
 
 		 318 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1865  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  29.04 
 
 		 313 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0081  purine nucleosidase  31 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.96 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0642  ribonucleoside hydrolase RihC  29.12 
 
 		 302 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0154  ribonucleoside hydrolase RihC  25.84 
 
 		 296 aa  94.4  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5234  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.71 
 
 		 309 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604929  hitchhiker  0.000866911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3071  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.3 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.474461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  29.29 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0742  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  30.28 
 
 		 321 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3178  ribonucleoside hydrolase 1  29.71 
 
 		 318 aa  93.6  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0718  ribonucleoside hydrolase 1  30.9 
 
 		 311 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  29.17 
 
 		 309 aa  93.6  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3626  Ribosylpyrimidine nucleosidase  32.35 
 
 		 308 aa  92.8  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0811  ribonucleoside hydrolase 1  31.3 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3734  Ribosylpyrimidine nucleosidase  31.9 
 
 		 310 aa  92.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1158  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.07 
 
 		 318 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2309  ribonucleoside hydrolase 2  32.92 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.19142  hitchhiker  0.000812735 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1863  ribonucleoside hydrolase 1  30.23 
 
 		 322 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.742774  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3232  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.57 
 
 		 318 aa  91.3  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.594476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0797  ribonucleoside hydrolase RihC  28.02 
 
 		 310 aa  91.3  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0129973  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6548  Ribosylpyrimidine nucleosidase  30.09 
 
 		 312 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3659  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.87 
 
 		 313 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.121445  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3240  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.05 
 
 		 302 aa  90.9  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206902  normal  0.22308 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.77 
 
 		 314 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140534 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2632  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  29.76 
 
 		 319 aa  89.7  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02091  ribonucleoside hydrolase 2  32.51 
 
 		 313 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1486  ribonucleoside hydrolase 2  32.51 
 
 		 313 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  hitchhiker  0.000862517 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2298  ribonucleoside hydrolase 2  32.51 
 
 		 313 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02050  hypothetical protein  32.51 
 
 		 313 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1496  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.51 
 
 		 313 aa  89.4  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0365306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2459  ribonucleoside hydrolase 2  32.51 
 
 		 313 aa  89.4  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1981  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.842213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3298  ribonucleoside hydrolase 2  32.51 
 
 		 313 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0466718  normal  0.0924764 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.45 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377078  normal  0.0385761 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2680  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.22 
 
 		 322 aa  87.8  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0697  ribonucleoside hydrolase 1  29.66 
 
 		 335 aa  87.8  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3465  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.83 
 
 		 307 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3224  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.57 
 
 		 319 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00529527  normal  0.234301 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2170  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  27.14 
 
 		 312 aa  87  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0382277  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2618  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.52 
 
 		 369 aa  86.7  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0234  purine nucleosidase  28.62 
 
 		 311 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0228  purine nucleosidase  28.62 
 
 		 311 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2125  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.41 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.601271  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0651  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.91 
 
 		 321 aa  86.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2236  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  26.77 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2156  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  26.88 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2400  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  26.77 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>