79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0087 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0087  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.906418  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0710  hypothetical protein  36.98 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4466  hypothetical protein  38.17 
 
 		 194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0340975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0988  hypothetical protein  39.68 
 
 		 193 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194666 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2339  hypothetical protein  37.06 
 
 		 197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.940774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1753  hypothetical protein  37.06 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00151115  hitchhiker  0.00163692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4355  hypothetical protein  36.02 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4050  hypothetical protein  36.96 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0961  hypothetical protein  38.17 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0922  hypothetical protein  38.17 
 
 		 194 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01963  hypothetical protein  37.44 
 
 		 201 aa  124  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.156408  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3015  hypothetical protein  36.51 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2895  hypothetical protein  34.87 
 
 		 197 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.955163  hitchhiker  0.00783232 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56600  hypothetical protein  35.48 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37780  hypothetical protein  35.87 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3540  hypothetical protein  34.85 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0682699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1285  hypothetical protein  36.56 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4924  hypothetical protein  35.48 
 
 		 190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000200  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.85 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0363622  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1468  hypothetical protein  33.51 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2704  hypothetical protein  33.67 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000930637  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1399  hypothetical protein  34.67 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0629048  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2389  hypothetical protein  31.98 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000200832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05934  hypothetical protein  32.5 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1921  protein of unknown function DUF479  33.67 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2195  hypothetical protein  34.21 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0492797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1122  hypothetical protein  33.69 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.886376 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1059  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.41 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0191008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1928  protein of unknown function DUF479  31.82 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3099  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.87 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.481027  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2908  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.99 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0492  protein of unknown function DUF479  31.55 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1590  hypothetical protein  31.22 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2071  hypothetical protein  32.62 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1066  protein of unknown function DUF479  29.85 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4505  hypothetical protein  28.65 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0323  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.04 
 
 		 193 aa  96.3  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.22 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.953041  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08831  hypothetical protein  30.69 
 
 		 201 aa  95.1  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.777413  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1017  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.75 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2334  hypothetical protein  30.1 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000761485  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0128  protein of unknown function DUF479  27.89 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00458554  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0442  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.98 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0873  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.62 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0443  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.98 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0461  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.98 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0503  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.98 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0448  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.98 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00566103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0484  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.51 
 
 		 193 aa  92  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00352  putative glycoprotein  33.51 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3205  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.51 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.711394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00356  hypothetical protein  33.51 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0436  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.51 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3229  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.51 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.923906  hitchhiker  0.000000145385 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0434  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.51 
 
 		 193 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0474  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.51 
 
 		 193 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1687  hypothetical protein  32.65 
 
 		 199 aa  91.3  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1184  hypothetical protein  28.92 
 
 		 194 aa  91.3  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0100066  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3386  hypothetical protein  34.67 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0331175  normal  0.675474 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3266  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.17 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00477241  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3125  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.66 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0307905  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2033  protein of unknown function DUF479  27.23 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1946  protein of unknown function DUF479  28.95 
 
 		 203 aa  84.7  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2364  protein of unknown function DUF479  29.57 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1567  protein of unknown function DUF479  25.87 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0469994  hitchhiker  0.0000024358 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2790  hypothetical protein  25.37 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237471  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2885  hypothetical protein  25.87 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.210491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2810  hypothetical protein  25.87 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0120945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2184  protein of unknown function DUF479  27.75 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1921  hypothetical protein  32.09 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.506882  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2487  hypothetical protein  24.38 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2473  hypothetical protein  24.86 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3116  hypothetical protein  24 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1432  hypothetical protein  24.5 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.205377  hitchhiker  0.00400563 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1444  hypothetical protein  24 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.408257  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1379  hypothetical protein  23 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.670968  hitchhiker  0.000107714 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2009  protein of unknown function DUF479  25.61 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3739  amino acid adenylation domain protein  31.87 
 
 		 1193 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133452  normal  0.0805981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3685  amino acid adenylation domain protein  31.87 
 
 		 1193 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>