47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0085 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0085  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  586  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.720281  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3004  peptidase S15  26.95 
 
 		 282 aa  93.2  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0110068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  27.1 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  26.69 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  25.65 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  28.3 
 
 		 408 aa  65.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.27 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 274 aa  62  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0508  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  29.08 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1305  hypothetical protein  28.87 
 
 		 341 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0589  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.532297 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  24.15 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  28.36 
 
 		 260 aa  50.1  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2263  alpha/beta hydrolase  25.58 
 
 		 315 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  23.85 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1585  hypothetical protein  33.33 
 
 		 588 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.101596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.18 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3320  putative hydrolase  21.43 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.859437  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  25.65 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  26.64 
 
 		 281 aa  46.6  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0104  hypothetical protein  28.9 
 
 		 344 aa  46.2  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0271109 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1082  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 334 aa  46.2  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.449136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1666  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.993525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3286  alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0736  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.92 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0426  hypothetical protein  27.21 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.814085  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3824  Esterase/lipase-like protein  24.9 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00729538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3329  hypothetical protein  28.18 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.834886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 504 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1212  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 344 aa  43.9  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  28.91 
 
 		 413 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3398  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  21.91 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  25.4 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  23.18 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  21.91 
 
 		 294 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  22.71 
 
 		 270 aa  43.1  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  19.41 
 
 		 254 aa  43.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  21.91 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 		 290 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  21.91 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.25 
 
 		 315 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>