More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0080 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0080  glycogen synthase  100 
 
 		 476 aa  994    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572578  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00278  glycogen synthase  52.77 
 
 		 474 aa  540  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3035  glycogen synthase  49.49 
 
 		 488 aa  479  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1329  glycogen synthase  48.55 
 
 		 484 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147242  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003946  glycogen synthase ADP-glucose transglucosylase  46.28 
 
 		 485 aa  425  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01576  glycogen synthase  46.8 
 
 		 486 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0239  glycogen synthase  44.35 
 
 		 482 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  39.67 
 
 		 484 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.94 
 
 		 475 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.51 
 
 		 475 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.89 
 
 		 486 aa  348  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.09 
 
 		 486 aa  347  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.43 
 
 		 494 aa  347  3e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.3 
 
 		 475 aa  346  6e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.45 
 
 		 480 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  39.6 
 
 		 493 aa  335  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.8 
 
 		 509 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.16 
 
 		 484 aa  332  8e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.94 
 
 		 587 aa  330  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.17 
 
 		 504 aa  330  3e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.88 
 
 		 477 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  39.26 
 
 		 492 aa  327  2.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6185  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.45 
 
 		 525 aa  325  7e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0114021 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.53 
 
 		 497 aa  326  7e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.94 
 
 		 507 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.21 
 
 		 488 aa  323  5e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.74 
 
 		 477 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.93 
 
 		 500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  38.88 
 
 		 484 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.12 
 
 		 487 aa  320  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.89 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.68 
 
 		 493 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  36.29 
 
 		 501 aa  320  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.77 
 
 		 497 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.27 
 
 		 491 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  40.37 
 
 		 486 aa  320  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.08 
 
 		 488 aa  320  5e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.42 
 
 		 506 aa  320  5e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.08 
 
 		 502 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  40.61 
 
 		 486 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.24 
 
 		 534 aa  317  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  37.42 
 
 		 476 aa  316  5e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.27 
 
 		 491 aa  316  7e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  39.8 
 
 		 486 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.66 
 
 		 484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.96 
 
 		 480 aa  314  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  39.02 
 
 		 489 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.02 
 
 		 489 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.85 
 
 		 481 aa  312  1e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.01 
 
 		 518 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.1 
 
 		 488 aa  310  4e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1839  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.03 
 
 		 503 aa  309  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.33 
 
 		 496 aa  309  6.999999999999999e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.95 
 
 		 496 aa  309  8e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.8 
 
 		 493 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.14 
 
 		 486 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  35.36 
 
 		 484 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.14 
 
 		 486 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  38.14 
 
 		 487 aa  304  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1582  glycogen synthase  34.84 
 
 		 491 aa  303  4.0000000000000003e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0042939  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.06 
 
 		 481 aa  301  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.43 
 
 		 478 aa  302  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.08 
 
 		 498 aa  301  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  36.8 
 
 		 485 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  35.62 
 
 		 480 aa  299  9e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  35.83 
 
 		 476 aa  299  9e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  35.83 
 
 		 476 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  35.42 
 
 		 480 aa  296  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.47 
 
 		 488 aa  296  5e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  35.42 
 
 		 476 aa  296  6e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  35.42 
 
 		 498 aa  295  9e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  35.62 
 
 		 480 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.24 
 
 		 508 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  35.42 
 
 		 498 aa  295  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.44 
 
 		 489 aa  294  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  35.21 
 
 		 498 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  35.21 
 
 		 498 aa  293  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.86 
 
 		 485 aa  292  9e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.22 
 
 		 480 aa  292  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  38.6 
 
 		 486 aa  291  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.93 
 
 		 499 aa  289  6e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0886  glycogen synthase  37.04 
 
 		 479 aa  290  6e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4644  glycogen synthase  37.37 
 
 		 477 aa  289  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.755031 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.1 
 
 		 491 aa  288  1e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.93 
 
 		 485 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.8 
 
 		 491 aa  288  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  37.35 
 
 		 556 aa  286  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5336  glycogen synthase  36.42 
 
 		 544 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0149389 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.89 
 
 		 473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.02 
 
 		 482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.75 
 
 		 467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.17 
 
 		 489 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  34.7 
 
 		 477 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  34.09 
 
 		 478 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4775  glycogen synthase  35.34 
 
 		 472 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.77 
 
 		 494 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1128  glycogen synthase  34.03 
 
 		 477 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1159  glycogen synthase  34.03 
 
 		 477 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0241864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  35.6 
 
 		 477 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  35.93 
 
 		 478 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>