More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0077 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0077  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
243 aa  502  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00281  putative hydrolase  38.86 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.210482  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1108  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
232 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2368  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 
219 aa  94.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  32.16 
 
 
237 aa  85.5  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 
233 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  25.86 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2089  alpha/beta hydrolase  28.31 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  22.94 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  25.55 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  23.86 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0856  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000204036 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1718  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  26.04 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.59 
 
 
425 aa  65.9  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.39 
 
 
372 aa  65.1  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 
265 aa  65.1  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.75 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  26.11 
 
 
245 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5610  alpha/beta hydrolase fold protein  29.19 
 
 
269 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1827  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
260 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.518334  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22.73 
 
 
277 aa  62.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
239 aa  62.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  27.18 
 
 
285 aa  62  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
264 aa  62  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2813  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  27.17 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  24.45 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1738  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44874  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 
264 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 
275 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
271 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  26.11 
 
 
275 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  27.75 
 
 
256 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
263 aa  59.7  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  27.75 
 
 
256 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  27.75 
 
 
256 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  23.21 
 
 
227 aa  58.5  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  23.6 
 
 
263 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 
237 aa  58.5  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3900  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.479584 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  25.69 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  29.61 
 
 
262 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  28.44 
 
 
276 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 
264 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4169  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
265 aa  55.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  29.73 
 
 
279 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  27.32 
 
 
282 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  28.65 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.35 
 
 
400 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  28.65 
 
 
286 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2559  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  27.66 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175086  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0833  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
287 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  22.42 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  25.71 
 
 
287 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.348936 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02190  predicted peptidase  27.66 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1394  alpha/beta hydrolase fold protein  27.66 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  24.7 
 
 
393 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  27.66 
 
 
380 aa  52.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 
311 aa  52.8  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02149  hypothetical protein  27.66 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3405  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  26.54 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0367358  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  24.28 
 
 
263 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
277 aa  52.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  23.78 
 
 
263 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  28.05 
 
 
263 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  27.89 
 
 
266 aa  52  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 
312 aa  52  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  22.36 
 
 
263 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2493  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  26.59 
 
 
252 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.220295  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2548  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  26.59 
 
 
252 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.13969  normal  0.758429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 
260 aa  52  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 
268 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  22.36 
 
 
263 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  25.21 
 
 
256 aa  52  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  26.77 
 
 
7149 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  25.12 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  26.97 
 
 
262 aa  51.2  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.365456  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2536  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  26.59 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  26.7 
 
 
283 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2409  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  27.66 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0325408  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
301 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  26.7 
 
 
283 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1385  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  27.13 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2444  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  26.59 
 
 
252 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0199613  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 
253 aa  50.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>