More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0074 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 275 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  32.5 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 298 aa  139  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  29.66 
 
 		 271 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  32.51 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 350 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 		 350 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3192  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 267 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 		 361 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3153  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0769848 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3137  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2524  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191212  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 291 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 291 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 291 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 322 aa  115  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 291 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6254  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  30.18 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  29.69 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 340 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.66 
 
 		 287 aa  108  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 340 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 340 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.72 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  26.84 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  25.49 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  30.04 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  30.04 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  25.56 
 
 		 302 aa  105  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 340 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 		 297 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 345 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  27.54 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  27.24 
 
 		 341 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  26.03 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 329 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0430  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 		 296 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1124  hydrolase/oxidase  28.32 
 
 		 292 aa  102  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  25.77 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 277 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  27.02 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 287 aa  102  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  25.7 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 339 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  40.83 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.8 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 323 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  27.61 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>