More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0056 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0056  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 358 aa  741    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03358  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  70.95 
 
 		 362 aa  500  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  65.44 
 
 		 364 aa  488  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  52.92 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  42.32 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  38.79 
 
 		 354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  38.79 
 
 		 354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  37.68 
 
 		 349 aa  232  9e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  36.89 
 
 		 348 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1661  glycosyl transferase group 1  39.65 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.781616  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2977  glycosyl transferase group 1  37.57 
 
 		 352 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.179436  normal  0.153707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3128  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  40.6 
 
 		 367 aa  224  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360612  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  37.07 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5673  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  36.89 
 
 		 348 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.108379 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  37.07 
 
 		 344 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2716  glycosyl transferase group 1  37.57 
 
 		 352 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  37.82 
 
 		 351 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  37.64 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0983  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase lpcC  36.58 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.327737  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  36.78 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 		 370 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 386 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  26.51 
 
 		 383 aa  89.7  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.67 
 
 		 387 aa  88.6  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 		 452 aa  86.3  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 377 aa  85.9  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 		 421 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  28.29 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  26.95 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 810 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  28.57 
 
 		 388 aa  79.7  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 		 398 aa  79.3  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.38 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.38 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.38 
 
 		 498 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.38 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.38 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.38 
 
 		 495 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.38 
 
 		 499 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  24.6 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.88 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  23.08 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  24.88 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0180  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 426 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 453 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  25.81 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  28.89 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  26.15 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  21.4 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  27.31 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 		 750 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  27.73 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  22.71 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>