52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0055 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0055  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  100 
 
 		 239 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00060  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  48.56 
 
 		 214 aa  229  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3706  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  44.86 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0043809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0330  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  44.84 
 
 		 231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00664  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  43.53 
 
 		 238 aa  208  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0117  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  43.29 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001809  3-deoxy-D-manno-octulosonic acid kinase  44.4 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0068  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  45.58 
 
 		 252 aa  201  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000292755 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2607  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.94 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221231  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0182  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.52 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0241  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.52 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0101  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.42 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139094 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1694  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  38.22 
 
 		 236 aa  191  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0105  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  46.76 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3612  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  43.58 
 
 		 249 aa  185  5e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0110  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.72 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4677  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.06 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3898  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.19 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.217964  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3935  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.28 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0314402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3897  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.12 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0061  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.53 
 
 		 251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0783873  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4337  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.53 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4477  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40 
 
 		 251 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.621367 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3989  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.52 
 
 		 250 aa  171  9e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4282  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.53 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676386 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4101  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.06 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238645 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0015  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.19 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2807  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  36.55 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.7235 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0306  lipopolysaccharide kinase  36.56 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0778  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.04 
 
 		 239 aa  148  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0850  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  37.62 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1357  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  37.62 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1292  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  37.14 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2259  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  38.97 
 
 		 244 aa  138  6e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02451  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  34.98 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0524  lipopolysaccharide kinase  29.06 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0469  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  29.91 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.365356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44820  lipopolysaccharide kinase  26.62 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4858  lipopolysaccharide kinase  28.57 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4999  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  27.35 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0345  lipopolysaccharide kinase  28.57 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0373  lipopolysaccharide kinase  28.57 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66210  hypothetical protein  26.47 
 
 		 244 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5743  hypothetical protein  27.21 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.744614  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0370  lipopolysaccharide kinase  26.27 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40859  predicted protein  27.97 
 
 		 320 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1269  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  22.88 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  20.92 
 
 		 334 aa  43.9  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3650  RIO-like kinase  27.13 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4857  ABC-1 domain protein  25.53 
 
 		 646 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.982247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0583  lipopolysaccharide kinase  26.5 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0886843 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2087  RIO-like kinase  27.34 
 
 		 291 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>