262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0047 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0047  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 270 aa  567  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4972  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3741  putative glycosyltransferase  53.38 
 
 		 275 aa  305  5.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06135  putative glycosyltransferase  50 
 
 		 272 aa  270  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614434  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06140  putative glycosyltransferase  40 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0072  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0395355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  35.44 
 
 		 280 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  35.86 
 
 		 280 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  36.07 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0247  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0176  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0331  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 		 278 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02865  putative glycosyltransferase  33.05 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1798  hypothetical protein  33.46 
 
 		 268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  31.48 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3699  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1547  glycosyl transferase family 2  32.49 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123208  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  32.78 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0388  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1546  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151048  normal  0.921915 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  31.11 
 
 		 515 aa  98.6  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  28.73 
 
 		 516 aa  96.3  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  27.52 
 
 		 515 aa  91.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  37.36 
 
 		 348 aa  62  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  26.88 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2972  WbdO  38.54 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.354784  hitchhiker  0.000000078637 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.25 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  26.67 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1431  glycosyltransferase-like protein  32.69 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  23.57 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1716  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsA  30.93 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000743548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2772  b-glycosyltransferase  31.69 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 296 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0518  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 		 341 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 		 684 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.61 
 
 		 295 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 		 373 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 		 289 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.66 
 
 		 326 aa  53.1  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  30.21 
 
 		 300 aa  52.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  32.35 
 
 		 344 aa  52.4  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.08 
 
 		 334 aa  52.4  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 		 322 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 		 338 aa  52.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.09 
 
 		 326 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1715  protein CgeD  27.56 
 
 		 428 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136897 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 		 322 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  37.89 
 
 		 731 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28 
 
 		 312 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 		 1035 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  25 
 
 		 754 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.57 
 
 		 326 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  30.69 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0211  glycosyltransferase  33.66 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  24.72 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 341 aa  50.4  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  22.17 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.57 
 
 		 326 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 		 303 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 		 335 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0310  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0112917  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 291 aa  49.7  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 		 344 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 544 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 		 301 aa  49.3  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 		 344 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5475  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 313 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  31.18 
 
 		 397 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.47 
 
 		 326 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0287  glycosyl transferase family 2  25.57 
 
 		 315 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0081  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 605 aa  49.3  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  34.78 
 
 		 327 aa  48.9  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 		 310 aa  48.9  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 		 329 aa  48.9  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0308  glycosyltransferase  31.13 
 
 		 309 aa  48.9  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3408  glycosyl transferase family protein  24.59 
 
 		 352 aa  48.9  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 		 299 aa  48.9  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 334 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  28.71 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1385  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593757  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 		 632 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  24.72 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  32.26 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  31.87 
 
 		 1157 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>