244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0044 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  100 
 
 		 197 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00047  nucleoid occlusion protein  83.51 
 
 		 195 aa  329  1e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  65.64 
 
 		 197 aa  273  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3773  nucleoid occlusion protein  65.64 
 
 		 197 aa  274  8e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.461125 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  65.64 
 
 		 197 aa  273  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  65.64 
 
 		 197 aa  273  8e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0374  nucleoid occlusion protein  65.64 
 
 		 197 aa  273  8e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4251  nucleoid occlusion protein  65.13 
 
 		 197 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3600  nucleoid occlusion protein  65.13 
 
 		 197 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.741133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0356  nucleoid occlusion protein  65.13 
 
 		 197 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4564  nucleoid occlusion protein  65.64 
 
 		 197 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000269162  unclonable  0.0000000294752 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0459  nucleoid occlusion protein  64.62 
 
 		 197 aa  270  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126678  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3831  nucleoid occlusion protein  63.08 
 
 		 197 aa  264  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3840  nucleoid occlusion protein  65.64 
 
 		 197 aa  262  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00664895  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3484  nucleoid occlusion protein  65.64 
 
 		 197 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000984177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  65.98 
 
 		 210 aa  256  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0382  nucleoid occlusion protein  64.62 
 
 		 197 aa  256  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135011  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0324  nucleoid occlusion protein  64.62 
 
 		 197 aa  255  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  63.4 
 
 		 196 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0323  nucleoid occlusion protein  63.59 
 
 		 197 aa  251  6e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000549659  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  62.89 
 
 		 196 aa  250  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0181  nucleoid occlusion protein  61.08 
 
 		 198 aa  247  8e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0059  nucleoid occlusion protein  59.26 
 
 		 200 aa  241  3.9999999999999997e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0445493  normal  0.11202 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  62.37 
 
 		 196 aa  236  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  57.51 
 
 		 197 aa  232  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2985  nucleoid occlusion protein  62.3 
 
 		 205 aa  231  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111899  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  56.12 
 
 		 199 aa  228  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4103  nucleoid occlusion protein  60.94 
 
 		 198 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0313607  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03498  nucleoid occlusion protein  58.95 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0113918  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0064  transcriptional regulator, TetR family  58.95 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000175826  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5011  nucleoid occlusion protein  58.95 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0450587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3850  nucleoid occlusion protein  58.95 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201623  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03450  hypothetical protein  58.95 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00837733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0070  nucleoid occlusion protein  58.95 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000194925  unclonable  0.00000000943905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3976  nucleoid occlusion protein  58.95 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.027184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4066  nucleoid occlusion protein  58.95 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00270158  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4142  nucleoid occlusion protein  58.95 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000526151  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0098  nucleoid occlusion protein  58.95 
 
 		 198 aa  219  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0100985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4845  nucleoid occlusion protein  59.39 
 
 		 198 aa  218  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111456  decreased coverage  0.000000677674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4119  nucleoid occlusion protein  59.47 
 
 		 198 aa  218  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4012  nucleoid occlusion protein  59.47 
 
 		 198 aa  218  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.554445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3931  nucleoid occlusion protein  59.47 
 
 		 198 aa  218  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0886736  hitchhiker  0.000487739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3949  nucleoid occlusion protein  59.47 
 
 		 198 aa  218  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4058  nucleoid occlusion protein  59.47 
 
 		 198 aa  218  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4393  nucleoid occlusion protein  61.05 
 
 		 198 aa  218  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000163426  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0155  nucleoid occlusion protein  61.38 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.894699  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0058  nucleoid occlusion protein  60.53 
 
 		 198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00579463  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0052  nucleoid occlusion protein  60.53 
 
 		 198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.881528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4158  nucleoid occlusion protein  60.53 
 
 		 198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000407134  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3963  nucleoid occlusion protein  60.53 
 
 		 198 aa  211  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000172432  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  53.48 
 
 		 195 aa  204  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  50.8 
 
 		 219 aa  188  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1117  nucleoid occlusion protein  51.04 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.862438  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2257  nucleoid occlusion protein  51.65 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.178912  hitchhiker  0.0000216309 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3979  nucleoid occlusion protein  50.56 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0627  nucleoid occlusion protein  50.26 
 
 		 202 aa  174  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.375777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0031  nucleoid occlusion protein  50 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3719  nucleoid occlusion protein  50.54 
 
 		 216 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3396  nucleoid occlusion protein  50.54 
 
 		 216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2012  nucleoid occlusion protein  53.07 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4387  nucleoid occlusion protein  46.8 
 
 		 233 aa  171  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1729  nucleoid occlusion protein  51.91 
 
 		 216 aa  171  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0182  nucleoid occlusion protein  47.25 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847466  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0336  nucleoid occlusion protein  46.19 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0542  nucleoid occlusion protein  51.69 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  53.8 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0062  nucleoid occlusion protein  46.38 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3007  nucleoid occlusion protein  45.92 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.8305 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3247  nucleoid occlusion protein  45.45 
 
 		 229 aa  168  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2908  nucleoid occlusion protein  45.45 
 
 		 229 aa  168  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.946505  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2181  nucleoid occlusion protein  45.45 
 
 		 229 aa  168  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3440  nucleoid occlusion protein  45.45 
 
 		 229 aa  168  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0142  nucleoid occlusion protein  46.7 
 
 		 216 aa  167  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0183  nucleoid occlusion protein  45.45 
 
 		 229 aa  167  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.24476  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0193  nucleoid occlusion protein  45.45 
 
 		 229 aa  167  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3094  nucleoid occlusion protein  48.45 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.483047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0777  nucleoid occlusion protein  47.37 
 
 		 217 aa  165  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1324  nucleoid occlusion protein  45.64 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892359 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0501  nucleoid occlusion protein  45.5 
 
 		 220 aa  164  8e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.957497  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0378  nucleoid occlusion protein  44.72 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3521  nucleoid occlusion protein  44.76 
 
 		 240 aa  162  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2484  nucleoid occlusion protein  45.13 
 
 		 220 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.11022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3098  nucleoid occlusion protein  45.13 
 
 		 220 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170288  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6449  nucleoid occlusion protein  44.9 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0158  nucleoid occlusion protein  43.28 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3114  nucleoid occlusion protein  44.39 
 
 		 221 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4136  nucleoid occlusion protein  42.78 
 
 		 224 aa  157  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.925695  hitchhiker  0.00000191569 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3145  nucleoid occlusion protein  45.21 
 
 		 191 aa  154  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0589  nucleoid occlusion protein  43.18 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45381  normal  0.299357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0569  nucleoid occlusion protein  42.61 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>