74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0026 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0026  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  324  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00025  smg protein  86.08 
 
 		 158 aa  288  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0023  smg protein  69.62 
 
 		 157 aa  226  7e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0027  hypothetical protein  67.92 
 
 		 157 aa  213  7e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0027  hypothetical protein  69.81 
 
 		 157 aa  213  9e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0041  hypothetical protein  67.92 
 
 		 157 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.479355 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0038  hypothetical protein  69.18 
 
 		 157 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0240972  normal  0.0588054 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3733  hypothetical protein  67.92 
 
 		 157 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0219061  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4509  hypothetical protein  66.46 
 
 		 157 aa  212  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000588298  hitchhiker  0.000163466 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0038  hypothetical protein  68.12 
 
 		 158 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.272353  hitchhiker  0.00000478432 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00388  hypothetical protein  63.92 
 
 		 159 aa  210  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0358  hypothetical protein  66.46 
 
 		 157 aa  210  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0362316  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0032  hypothetical protein  68.12 
 
 		 158 aa  209  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.263953  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0030  hypothetical protein  68.12 
 
 		 158 aa  209  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3966  hypothetical protein  65.16 
 
 		 157 aa  209  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0034  protein of unknown function DUF494  67.3 
 
 		 157 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000345632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0027  hypothetical protein  67.3 
 
 		 157 aa  209  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0030  hypothetical protein  67.3 
 
 		 157 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0034  hypothetical protein  67.3 
 
 		 157 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0035  hypothetical protein  67.3 
 
 		 157 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3787  hypothetical protein  66.03 
 
 		 157 aa  207  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00193102  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0035  smg protein  67.5 
 
 		 158 aa  208  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0441  hypothetical protein  65.82 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0817178  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2470  hypothetical protein  62.89 
 
 		 158 aa  202  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0034  hypothetical protein  66.04 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002060  hypothetical protein  63.29 
 
 		 159 aa  202  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3716  hypothetical protein  63.52 
 
 		 157 aa  194  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195786  hitchhiker  0.0087907 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0078  hypothetical protein  58.23 
 
 		 157 aa  191  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4607  hypothetical protein  62.89 
 
 		 157 aa  191  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0145872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3767  hypothetical protein  62.89 
 
 		 157 aa  191  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000724852  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3580  hypothetical protein  62.89 
 
 		 157 aa  191  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0216587  normal  0.15109 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0429  hypothetical protein  62.26 
 
 		 157 aa  189  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000035196  hitchhiker  0.000953721 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03086  hypothetical protein  62.26 
 
 		 157 aa  189  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132908  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0429  protein of unknown function DUF494  62.26 
 
 		 157 aa  189  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0295235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3478  hypothetical protein  62.26 
 
 		 157 aa  189  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000737993  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03135  hypothetical protein  62.26 
 
 		 157 aa  189  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0891254  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3771  hypothetical protein  62.26 
 
 		 157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3600  hypothetical protein  62.26 
 
 		 157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3601  hypothetical protein  62.26 
 
 		 157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.967939  normal  0.75952 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3708  hypothetical protein  62.26 
 
 		 157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0588951  normal  0.0775927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3673  hypothetical protein  62.26 
 
 		 157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3669  hypothetical protein  62.26 
 
 		 157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00596599  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0318  hypothetical protein  60.13 
 
 		 157 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0553382  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0619  hypothetical protein  60.13 
 
 		 157 aa  186  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000133668  normal  0.0223362 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3880  hypothetical protein  60.13 
 
 		 157 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000155024  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0046  hypothetical protein  57.76 
 
 		 159 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.249681  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3011  hypothetical protein  51.9 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2840  hypothetical protein  48.1 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0192  hypothetical protein  46.2 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2631  hypothetical protein  46.2 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1932  hypothetical protein  48.03 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1868  hypothetical protein  48.03 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3588  hypothetical protein  48.43 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2325  hypothetical protein  43.67 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.801617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0075  hypothetical protein  40.74 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04052  hypothetical protein  47.17 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2089  protein of unknown function DUF494  44.24 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.596862  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2276  protein of unknown function DUF494  44.87 
 
 		 161 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580971 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0190  hypothetical protein  38.61 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000607225 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0098  protein of unknown function DUF494  42.96 
 
 		 156 aa  98.2  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0087  hypothetical protein  35.44 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000255352  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2099  smg protein  35.44 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000321038  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0347  hypothetical protein  34.04 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0637077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0280  hypothetical protein  36.17 
 
 		 150 aa  87  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4642  hypothetical protein  35.76 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3863  hypothetical protein  31.58 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3882  hypothetical protein  34 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5116  protein of unknown function DUF494  30.92 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0407  hypothetical protein  27.69 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000667933  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0011  Smg protein  29.75 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0017  protein of unknown function DUF494  31.3 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.640555  normal  0.0565587 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0016  smg family protein  31.3 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2521  hypothetical protein  28.57 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2651  hypothetical protein  30.3 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>