27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0011 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0011  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  303  4.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00011  hypothetical protein  45.65 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0208  hypothetical protein  37.82 
 
 		 159 aa  90.1  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001912  hypothetical protein  37.24 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00580  hypothetical protein  36.15 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0471  hypothetical protein  41.46 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0232  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203963  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2403  hypothetical protein  32.64 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0054  hypothetical protein  29.41 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  normal  0.044221 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4824  hypothetical protein  28.31 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0088  hypothetical protein  30.41 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000738017  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0097  hypothetical protein  28.75 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3948  hypothetical protein  27.89 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4729  hypothetical protein  27.92 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0642  hypothetical protein  26.35 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4115  hypothetical protein  27.81 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3910  hypothetical protein  27.81 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.518185  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3625  hypothetical protein  31.53 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.638211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0091  hypothetical protein  27.63 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156914  hitchhiker  0.000348756 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4002  hypothetical protein  29.8 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0048  hypothetical protein  29.91 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125105  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4350  hypothetical protein  29.91 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.488502  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4492  hypothetical protein  29.91 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4295  hypothetical protein  29.91 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.617343  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3912  hypothetical protein  27.21 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3719  hypothetical protein  30.93 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.144984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1796  hypothetical protein  28.17 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>