142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_R0024 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_1  tRNA-Ile  100 
 
 		 95 bp  109  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  94.23 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0020  tRNA-OTHER  97.73 
 
 		 122 bp  79.8  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.430944  hitchhiker  0.000000157514 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  97.73 
 
 		 101 bp  79.8  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.32778 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0003  tRNA-OTHER  95.45 
 
 		 112 bp  71.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0030  tRNA-Pro  95.45 
 
 		 106 bp  71.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0625472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0014  tRNA-Phe  93.75 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0656754 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0052  tRNA-Met  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  87.88 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0017  tRNA-Met  88.33 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000739472  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0007  tRNA-Met  94.87 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000654684  hitchhiker  0.0000516648 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0026  tRNA-OTHER  97.14 
 
 		 118 bp  61.9  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.196712 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0009  tRNA-Val  97.06 
 
 		 93 bp  60  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0037  tRNA-Val  97.06 
 
 		 90 bp  60  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0009  tRNA-Val  97.06 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257244  normal  0.321857 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0065  tRNA-Met  90 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466048  normal  0.688575 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0049  tRNA-Ile  94.59 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0008  tRNA-OTHER  100 
 
 		 130 bp  58  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0027  tRNA-Met  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0026  tRNA-Ile  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0042  tRNA-OTHER  94.59 
 
 		 95 bp  58  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0029  tRNA-Ile  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0016  tRNA-Met  85.94 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.562679  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0032  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 117 bp  56  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0460095  normal  0.912485 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0028  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0036  tRNA-Met  85.33 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0063  tRNA-Met  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0010  tRNA-OTHER  100 
 
 		 92 bp  54  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0026  tRNA-OTHER  100 
 
 		 92 bp  54  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.981984 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0019  tRNA-Pro  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.130187 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0038  tRNA-Gly  100 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000426137 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0037  tRNA-OTHER  100 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0043  tRNA-Val  94.12 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.341062 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0030  tRNA-Val  94.12 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.961249  hitchhiker  0.000190241 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0006  tRNA-Met  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0008  tRNA-Ile  90 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0015  tRNA-Phe  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000431362 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0010  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 97 bp  50.1  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0011  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 96 bp  50.1  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.935376  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0023  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0019  tRNA-OTHER  91.89 
 
 		 95 bp  50.1  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.661812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.875994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0026  tRNA-Ile  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.920419  normal  0.82978 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0048  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 97 bp  50.1  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0022  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 130 bp  50.1  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0024  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 97 bp  50.1  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0025  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 122 bp  50.1  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 99 bp  50.1  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0057  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.381014  normal  0.359244 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0024  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 93 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.5604 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0070  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.385957 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0037  tRNA-Ile  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0669061 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0028  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 100 bp  50.1  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0027  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 112 bp  50.1  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00420774  hitchhiker  0.0000150687 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0002  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00458741  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.355045  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0019  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0024  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0031  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0050  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.897689  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0046  tRNA-Ile  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0047  tRNA-Ile  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0029  tRNA-Ile  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0039  tRNA-Thr  100 
 
 		 95 bp  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.955774  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0004  tRNA-OTHER  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000377684  decreased coverage  0.000000420741 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0019  tRNA-Phe  100 
 
 		 109 bp  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0003  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 112 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0004  tRNA-OTHER  93.75 
 
 		 115 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0047  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000840593  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0043  tRNA-Met  90 
 
 		 94 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.571582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  MSED_1  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.345264 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0001  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.541635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0042  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0004  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0017  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 101 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0044  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 109 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.335529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0045  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0002  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 113 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0003  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.472682  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0044  tRNA-Met  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.55918  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0044  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0039  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.285038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0018  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.29875 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0014  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0012  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00521238  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0011  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0017  tRNA-Met  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0012  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 112 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0018  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 101 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0020  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 126 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.148409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>