48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_R0016 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_R0016  tRNA-His  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.036112 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0002  tRNA-His  100 
 
 		 72 bp  143  7e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.162169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0014  tRNA-His  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0043  tRNA-Met  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.571582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  100 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  TNEU_0  tRNA-OTHER  100 
 
 		 117 bp  50.1  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0005  tRNA-Asp  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.280636 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0039  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.147165  hitchhiker  0.000226333 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0014  tRNA-Asp  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0029  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0040  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0037  tRNA-Gly  100 
 
 		 97 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00420774  hitchhiker  0.0000150687 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0011  tRNA-Gly  100 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0026  tRNA-Gly  100 
 
 		 97 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0040  tRNA-Phe  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.738588 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0006  tRNA-Glu  100 
 
 		 80 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0002  tRNA-OTHER  100 
 
 		 80 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.087724 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0018  tRNA-OTHER  100 
 
 		 98 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.352421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0027  tRNA-OTHER  100 
 
 		 112 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0038  tRNA-Pro  100 
 
 		 100 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000044076  normal  0.0293745 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0012  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0020  tRNA-OTHER  100 
 
 		 126 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.148409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0018  tRNA-Pro  100 
 
 		 101 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0004  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_0  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00654824 
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t40  tRNA-Glu  100 
 
 		 130 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t55  tRNA-His  100 
 
 		 122 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0024  tRNA-Phe  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0028  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0032  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.998395  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0048  tRNA-Pro  100 
 
 		 97 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0005  tRNA-Phe  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 		 115 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.122607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0029  tRNA-OTHER  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000033077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0034  tRNA-Met  100 
 
 		 99 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0043  tRNA-OTHER  100 
 
 		 68 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0028  tRNA-Pro  100 
 
 		 100 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0001  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0006  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0014  tRNA-Phe  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0656754 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0018  tRNA-Pro  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0033  tRNA-Val  100 
 
 		 98 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0035  tRNA-Pro  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0040  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0045  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0562636  normal  0.0295646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>