196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2342 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2112  extracellular solute-binding protein  84.28 
 
 		 473 aa  833    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2342  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 477 aa  973    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.936887  normal  0.0125511 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1257  extracellular solute-binding protein  64.75 
 
 		 467 aa  595  1e-169  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1029  sugar-binding periplasmic protein  34.93 
 
 		 491 aa  246  9.999999999999999e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0247417 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0654  extracellular solute-binding protein family 1  33.11 
 
 		 554 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  29.19 
 
 		 454 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  31.15 
 
 		 415 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0808  arabinose ABC transporter, arabinose binding protein  28.51 
 
 		 620 aa  181  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 415 aa  176  8e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  31.03 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  31.02 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  29.78 
 
 		 412 aa  169  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 455 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 412 aa  165  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 		 432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 		 435 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  30.91 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  28.64 
 
 		 428 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 414 aa  143  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  28.1 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26610  carbohydrate-binding protein  27.48 
 
 		 425 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 430 aa  136  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  28.98 
 
 		 414 aa  133  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0882  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 419 aa  129  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.632389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1378  extracellular solute-binding protein family 1  31.69 
 
 		 420 aa  120  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3491  extracellular solute-binding protein family 1  31.69 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1482  extracellular solute-binding protein family 1  32.05 
 
 		 420 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3786  extracellular solute-binding protein family 1  31.4 
 
 		 419 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3817  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 421 aa  97.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284829  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4349  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 415 aa  96.7  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381076  hitchhiker  0.000997313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1150  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0392592  normal  0.752071 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3170  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0693  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.42 
 
 		 421 aa  95.1  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0998966  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3935  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 420 aa  94.4  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0774395  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0083  extracellular solute-binding protein family 1  28.71 
 
 		 429 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001061  ABC-type sugar transport system component  27.05 
 
 		 414 aa  93.6  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1695  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.157617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1113  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 		 431 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  29.23 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2284  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  24.93 
 
 		 410 aa  90.1  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.61221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4502  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 427 aa  90.1  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1292  glucose ABC transporter, periplasmic glucose-binding protein, putative  28.41 
 
 		 428 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.927491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  27.33 
 
 		 420 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  28.16 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4278  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 442 aa  88.6  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 425 aa  87.4  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1097  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 416 aa  87  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000486653  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1824  extracellular solute-binding protein family 1  23.35 
 
 		 449 aa  87  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3573  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 414 aa  87.4  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3404  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 413 aa  86.7  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 417 aa  86.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2520  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2430  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0860  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0321479  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4071  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.08 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00185695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1028  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00732462  normal  0.0899654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0628  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 415 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3689  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0929  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1013  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2416  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.230559  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0489  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0816838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0968  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278189  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0523  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2191  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.58 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537651  hitchhiker  0.00669154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3451  ABC sugar (maltose) transporter, periplasmic ligand binding protein  26.47 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0840  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 415 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1813  extracellular solute-binding protein family 1  21.92 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.53 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0828  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 415 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00532301  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6328  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4370  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0862  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2129  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  25.71 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3086  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  25.71 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2283  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 456 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  hitchhiker  0.0000190717 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0782  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2615  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.813067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3052  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2574  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.577743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  21.31 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1553  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  25.36 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0365178  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4209  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29280  sugar ABC transport system, periplasmic substrate-binding protein  24.7 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6972  extracellular solute-binding protein  21.72 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1515  extracellular solute-binding protein  21.72 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6314  extracellular solute-binding protein  21.72 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4321  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1090  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 417 aa  66.6  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0882  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297168  normal  0.673205 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>