92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2220 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  100 
 
 		 168 aa  336  9.999999999999999e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  78.57 
 
 		 175 aa  280  9e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  72.62 
 
 		 168 aa  265  2e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  49.7 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  49.7 
 
 		 173 aa  167  9e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.47 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  46.71 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0185  phosphodiesterase  36.59 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  41.18 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  39.02 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  39.02 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  37.04 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1362  phosphodiesterase  36.13 
 
 		 158 aa  114  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  36.75 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  36.75 
 
 		 171 aa  104  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  36.14 
 
 		 171 aa  104  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  32.26 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0024  phosphodiesterase  35.5 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  34.16 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  36.31 
 
 		 165 aa  97.4  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.22 
 
 		 167 aa  94.4  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.14 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  33.76 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.43 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3652  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.92 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  33.12 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  36 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  32.48 
 
 		 173 aa  70.5  0.000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0060  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.41 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.876718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  33.11 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1651  hypothetical protein  29.07 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000844745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.16 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0341  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.16 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.431716  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  27.63 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.06 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  37.25 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  30.57 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  28 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.46 
 
 		 227 aa  50.4  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  32.21 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  27.22 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  27.78 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  32 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.84 
 
 		 222 aa  47.4  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  25 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.65 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  31.31 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  31.31 
 
 		 172 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  31.31 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.37 
 
 		 222 aa  44.7  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  31.68 
 
 		 168 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 		 157 aa  44.3  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  31.61 
 
 		 222 aa  44.3  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  29.58 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  29.41 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.68 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.57 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.88 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.32 
 
 		 232 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.03 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.2 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  29.41 
 
 		 186 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.01 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.6 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  27.81 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  28.05 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  29.75 
 
 		 173 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25 
 
 		 156 aa  42  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  30.61 
 
 		 182 aa  42  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  31.65 
 
 		 181 aa  42  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3228  hypothetical protein  42.31 
 
 		 219 aa  41.6  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00856854  normal  0.0495142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  26.79 
 
 		 185 aa  41.6  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.06 
 
 		 186 aa  41.2  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  25.43 
 
 		 184 aa  41.2  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  25.43 
 
 		 183 aa  41.2  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.62 
 
 		 168 aa  41.2  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  25.43 
 
 		 183 aa  41.2  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  25.43 
 
 		 183 aa  41.2  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  25.43 
 
 		 183 aa  41.2  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  25.43 
 
 		 183 aa  41.2  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  25.43 
 
 		 184 aa  41.2  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  25.43 
 
 		 183 aa  41.2  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  31.09 
 
 		 174 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  26.53 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.43 
 
 		 183 aa  41.2  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1112  phosphodiesterase  42.31 
 
 		 188 aa  41.2  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.279035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.71 
 
 		 156 aa  40.8  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  25.51 
 
 		 636 aa  40.8  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  27.16 
 
 		 152 aa  40.8  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.93 
 
 		 173 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  21.71 
 
 		 180 aa  40.4  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>