More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2142 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2142  ABC transporter related  100 
 
 
305 aa  618  1e-176  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1087  ABC transporter related  71.05 
 
 
307 aa  429  1e-119  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.545891  normal  0.0171241 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1960  ABC transporter related  69.41 
 
 
306 aa  425  1e-118  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000146397  hitchhiker  0.00000000000000983668 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0216  ABC transporter related  64.8 
 
 
308 aa  400  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5470  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.68 
 
 
364 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.867721  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04080  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  42.8 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1105  ABC transporter related  42.62 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.788183  normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.43 
 
 
353 aa  196  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  41.83 
 
 
333 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  48.12 
 
 
399 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.24 
 
 
330 aa  192  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4874  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 
360 aa  192  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.368971 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.66 
 
 
362 aa  192  7e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.11 
 
 
357 aa  192  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  49.55 
 
 
344 aa  192  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.89 
 
 
354 aa  191  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  45.34 
 
 
353 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  40.24 
 
 
333 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  43.28 
 
 
353 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.02 
 
 
329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  45.69 
 
 
368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  37.01 
 
 
354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0209  ABC transporter-related protein  45.11 
 
 
333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.06 
 
 
354 aa  189  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.47 
 
 
330 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  44.86 
 
 
379 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2366  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.35 
 
 
367 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.63 
 
 
329 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  46.54 
 
 
337 aa  189  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1699  ABC transporter related  45.69 
 
 
355 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  39.84 
 
 
333 aa  188  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 
333 aa  188  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 
333 aa  188  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1180  ABC transporter related  39.29 
 
 
312 aa  188  9e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.584734 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 
333 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
353 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.24 
 
 
329 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
353 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.24 
 
 
366 aa  188  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 
366 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  44.02 
 
 
326 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  44.22 
 
 
376 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.68 
 
 
378 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  44.2 
 
 
341 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  39.44 
 
 
358 aa  187  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  44.92 
 
 
362 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.05 
 
 
355 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  43.81 
 
 
342 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3338  ABC transporter related  46.58 
 
 
352 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  43.63 
 
 
326 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  46.33 
 
 
350 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  42.11 
 
 
338 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  42.32 
 
 
348 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  46.33 
 
 
350 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  43.94 
 
 
329 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  42.32 
 
 
348 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.63 
 
 
329 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3680  ABC transporter related  42.8 
 
 
364 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  42.32 
 
 
348 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  46.33 
 
 
350 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  42.08 
 
 
350 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  43.63 
 
 
329 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  43.41 
 
 
323 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.75 
 
 
399 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 
351 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  43.94 
 
 
329 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  43.64 
 
 
353 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.64 
 
 
357 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  39.47 
 
 
350 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.56 
 
 
332 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.03 
 
 
360 aa  186  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0913  ABC transporter related  41.29 
 
 
361 aa  186  4e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.62 
 
 
359 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6870  ABC transporter related  45.15 
 
 
391 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 
353 aa  186  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  42.98 
 
 
387 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  45.66 
 
 
372 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4791  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.75 
 
 
374 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 
355 aa  186  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.38 
 
 
370 aa  186  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.98 
 
 
355 aa  185  7e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.54 
 
 
382 aa  185  7e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40128  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  45.49 
 
 
353 aa  185  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4444  ABC transporter related  45.37 
 
 
359 aa  185  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  45.66 
 
 
372 aa  185  8e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  43.75 
 
 
355 aa  185  8e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.59 
 
 
387 aa  185  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.66 
 
 
339 aa  185  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.42 
 
 
367 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4942  ABC transporter related protein  46.48 
 
 
339 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0955475  normal  0.393607 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  43.64 
 
 
353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  44.07 
 
 
353 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  43.54 
 
 
358 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.42 
 
 
354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  45.83 
 
 
356 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  43.39 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.19 
 
 
376 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0285  ABC transporter related  40.54 
 
 
334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0897858  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0442  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.06 
 
 
374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.826065  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3120  ABC transporter, ATPase subunit  43.87 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>