More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2137 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2137  transport system permease protein  100 
 
 		 307 aa  578  1e-164  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1955  transport system permease protein  57.05 
 
 		 307 aa  281  7.000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.443661  hitchhiker  1.2483500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1092  transport system permease protein  59.32 
 
 		 307 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00868751  hitchhiker  0.00152758 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1518  transport system permease protein  57.1 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000431091 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0039  transport system permease protein  31.34 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00235157  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  29.63 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  32.28 
 
 		 352 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0868  transport system permease protein  29.94 
 
 		 322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1577  transport system permease protein  35.92 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  34.97 
 
 		 312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  31.93 
 
 		 352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  31.49 
 
 		 352 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0039  transport system permease protein  30.53 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00831442  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  34.6 
 
 		 353 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  31.93 
 
 		 352 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  31.93 
 
 		 352 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  31.93 
 
 		 352 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  31.93 
 
 		 352 aa  116  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  31.93 
 
 		 352 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  31.93 
 
 		 352 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  31.49 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0521  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.15 
 
 		 704 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  35.29 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4067  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.95 
 
 		 702 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.696001 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0104  transport system permease protein  31.49 
 
 		 332 aa  112  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000364541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0100  transport system permease protein  31.49 
 
 		 332 aa  112  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0102196  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2719  transport system permease protein  33.91 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000728456  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  34.98 
 
 		 350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1389  iron (III) ABC transporter, permease  31.76 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.953687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2634  iron chelate ABC transporter permease protein  33.89 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000212766  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1602  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.74 
 
 		 696 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00028536 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  31.14 
 
 		 329 aa  109  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12518  iron(III) ABC transporter, permease protein, putative  31.35 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  31.6 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  35.69 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.13 
 
 		 704 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  32.49 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1156  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.23 
 
 		 696 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1636  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.23 
 
 		 696 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0420527  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  29.07 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  30.7 
 
 		 333 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  28.25 
 
 		 373 aa  106  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  30.14 
 
 		 334 aa  105  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4782  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.56 
 
 		 696 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144873  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  30.14 
 
 		 334 aa  105  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1611  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.88 
 
 		 696 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.531129  normal  0.0976725 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2788  transport system permease protein  35.96 
 
 		 335 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.890347 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30 
 
 		 678 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  32.98 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1985  transport system permease protein  34.43 
 
 		 348 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181756  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  33.45 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  32.11 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  35.34 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  32.75 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1283  transport system permease protein  32.59 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.679975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  34.77 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.66 
 
 		 678 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.66 
 
 		 678 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.66 
 
 		 678 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  31.21 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  31.82 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5018  ABC transporter membrane spanning protein (iron (III))  34.26 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1935  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.9 
 
 		 706 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.31 
 
 		 678 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2081  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.9 
 
 		 706 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.240812  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0275  transport system permease protein  34.46 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1257  transport system permease protein  28.72 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001071  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuD  33.1 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  33.79 
 
 		 347 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.63 
 
 		 694 aa  102  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1921  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.9 
 
 		 706 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403612  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  27.7 
 
 		 327 aa  102  7e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.9 
 
 		 706 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00292434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1630  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.9 
 
 		 706 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0779963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  32.06 
 
 		 342 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0868  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.9 
 
 		 706 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315628  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1187  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.9 
 
 		 706 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.704713  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  34.78 
 
 		 322 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  32.11 
 
 		 333 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  31.31 
 
 		 343 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.35 
 
 		 678 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2423  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.31 
 
 		 659 aa  102  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.204382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  29.68 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  31.63 
 
 		 350 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0655  transport system permease protein  34.25 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355285  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  33 
 
 		 381 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  34.35 
 
 		 334 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  34.77 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2111  transport system permease protein  32.07 
 
 		 391 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.453774  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  34.25 
 
 		 363 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.31 
 
 		 678 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  31.33 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  34.45 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1533  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.7 
 
 		 697 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1787  hemin ABC transporter, permease protein, putative  28.76 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1554  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.7 
 
 		 697 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554327  normal  0.61391 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  32.87 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1602  hemin ABC transporter, permease protein, putative  28.76 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  32.87 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  31.6 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>