85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2048 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  100 
 
 
82 aa  160  6e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  81.48 
 
 
81 aa  135  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  79.01 
 
 
81 aa  133  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  72.84 
 
 
81 aa  124  5e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  55.56 
 
 
90 aa  87.8  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  54.32 
 
 
86 aa  83.6  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  48.15 
 
 
81 aa  79.7  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000249681  unclonable  0.000000335999 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  42.5 
 
 
86 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  54.67 
 
 
87 aa  77  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000262554  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  41.25 
 
 
86 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  38.75 
 
 
86 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  39.51 
 
 
121 aa  70.1  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  54.32 
 
 
81 aa  69.7  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  38.75 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  38.75 
 
 
86 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  46.34 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  41.98 
 
 
84 aa  66.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  38.75 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  40.74 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  38.75 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  40.24 
 
 
82 aa  62.8  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  44.44 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  37.04 
 
 
84 aa  62  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  38.27 
 
 
85 aa  61.6  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  36.59 
 
 
82 aa  61.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  35.37 
 
 
82 aa  57  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000000299035  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  38.16 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  38.27 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  32.93 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  39.13 
 
 
153 aa  52  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  35.8 
 
 
87 aa  51.6  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0003  50S ribosomal protein L23P  36.25 
 
 
82 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000337619  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  45.12 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  38.71 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  40.96 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000423409  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  40.96 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  40.24 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  36.36 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  36.54 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05725  50S ribosomal protein L23  37.78 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  41.46 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2172  50S ribosomal protein L23  39.76 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267938  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1718  50S ribosomal protein L23  38.46 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0786377  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  40.66 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0363  50S ribosomal protein L23  38.46 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.674139  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  35.96 
 
 
100 aa  42.7  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  32.95 
 
 
94 aa  42.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  39.74 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  35.96 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  32.26 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  37.36 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  37.35 
 
 
94 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  37.35 
 
 
94 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  39.56 
 
 
98 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  34.09 
 
 
94 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  48.08 
 
 
95 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  39.56 
 
 
98 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  33.33 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  34.83 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  43.59 
 
 
94 aa  41.2  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  38.64 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  42.31 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  36.23 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  39.02 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  39.77 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  33.71 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  33.71 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108369  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  33.71 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000248684  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  39.02 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  38.24 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  0.0000115816 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  39.02 
 
 
94 aa  40.8  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  39.08 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  34.83 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0330  ribosomal protein L23  33.77 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  39.24 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  39.02 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  36.14 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4542  50S ribosomal protein L23  33.71 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172317  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  45.28 
 
 
96 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0758  50S ribosomal protein L23  34.15 
 
 
99 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156644  normal  0.0173378 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  48.08 
 
 
97 aa  40  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0322  50S ribosomal protein L23  39.76 
 
 
100 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00637694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>