88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1976 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  100 
 
 		 333 aa  675    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  94.59 
 
 		 333 aa  630  1e-179  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  94.89 
 
 		 333 aa  616  1e-175  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  92.19 
 
 		 331 aa  608  1e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  57.19 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  57.29 
 
 		 306 aa  357  9.999999999999999e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  55.89 
 
 		 327 aa  330  3e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  56.85 
 
 		 305 aa  323  3e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  49.35 
 
 		 339 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  49.35 
 
 		 339 aa  305  6e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  49.02 
 
 		 339 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  49.02 
 
 		 339 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  49.02 
 
 		 339 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  49.02 
 
 		 339 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  49.02 
 
 		 339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  48.05 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  48.84 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  47.8 
 
 		 337 aa  286  5e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  47.3 
 
 		 337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  47.46 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  47.16 
 
 		 313 aa  282  6.000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  47.46 
 
 		 340 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  47.12 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  46.53 
 
 		 302 aa  279  5e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  43.23 
 
 		 301 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  44.03 
 
 		 315 aa  267  1e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  48.47 
 
 		 337 aa  263  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  47.12 
 
 		 337 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  46.33 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  44.83 
 
 		 322 aa  259  6e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  44.26 
 
 		 321 aa  258  8e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  44.37 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  44.37 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  44.19 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  44.33 
 
 		 323 aa  245  9e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.62 
 
 		 317 aa  241  9e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.12 
 
 		 317 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  44.03 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.32 
 
 		 319 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  45.17 
 
 		 323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  41.44 
 
 		 318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.66 
 
 		 317 aa  239  5.999999999999999e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  43.77 
 
 		 323 aa  239  5.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  43.2 
 
 		 326 aa  238  8e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  40.19 
 
 		 321 aa  235  8e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  44.48 
 
 		 349 aa  235  8e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  44.83 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.24 
 
 		 329 aa  233  3e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  43.21 
 
 		 333 aa  232  5e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  43.96 
 
 		 324 aa  232  6e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.51 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.41 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  44.14 
 
 		 329 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.86 
 
 		 306 aa  228  2e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  43.99 
 
 		 333 aa  205  9e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  36.14 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  34.59 
 
 		 307 aa  179  8e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  31.94 
 
 		 303 aa  176  6e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  37.63 
 
 		 331 aa  169  7e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  34.22 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  33.33 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  31.95 
 
 		 309 aa  162  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  34.71 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  32.33 
 
 		 309 aa  149  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  32.57 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  34.84 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  35.29 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  33.33 
 
 		 328 aa  139  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  29 
 
 		 293 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  31.06 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  32.8 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  25.73 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  33.01 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  23.7 
 
 		 350 aa  106  6e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  32.35 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  25 
 
 		 351 aa  102  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1563  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  33.55 
 
 		 298 aa  99.4  8e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  25.25 
 
 		 390 aa  97.1  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  26.27 
 
 		 447 aa  94.7  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  24.33 
 
 		 570 aa  91.7  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  27.68 
 
 		 601 aa  92  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  29.07 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  24.5 
 
 		 576 aa  76.6  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.137974 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  24.5 
 
 		 576 aa  76.6  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  23.08 
 
 		 691 aa  74.3  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03116  transcription factor TFIIIB complex subunit Brf1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12730)  30.95 
 
 		 713 aa  62.8  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0572721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50377  predicted protein  31.82 
 
 		 755 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2469  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  30.85 
 
 		 102 aa  46.6  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>