230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1947 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  79.51 
 
 		 373 aa  644    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 372 aa  766    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  81.94 
 
 		 373 aa  628  1e-179  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  82.54 
 
 		 355 aa  627  1e-178  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  76.22 
 
 		 371 aa  607  9.999999999999999e-173  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  54.84 
 
 		 374 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  43.97 
 
 		 345 aa  229  7e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  42.07 
 
 		 298 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  35.69 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  35.44 
 
 		 283 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  36.1 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  36.58 
 
 		 305 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  34.67 
 
 		 320 aa  169  9e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  34.67 
 
 		 320 aa  169  9e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  39.02 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  36.5 
 
 		 303 aa  162  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  36.58 
 
 		 305 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  36.46 
 
 		 296 aa  160  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  35.37 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  37.41 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  38.52 
 
 		 336 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  36.2 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  37.72 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  36.13 
 
 		 313 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  35.66 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  37.14 
 
 		 301 aa  156  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  35.84 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  36.15 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  34.56 
 
 		 287 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  33.45 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  34.22 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  33.55 
 
 		 319 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  36.86 
 
 		 309 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  37.11 
 
 		 321 aa  146  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  33.94 
 
 		 312 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  35.21 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  34.9 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 		 302 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  34.16 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  35.05 
 
 		 373 aa  143  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  36.4 
 
 		 307 aa  143  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  34.24 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  35.23 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  34.35 
 
 		 286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  34.35 
 
 		 286 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  36 
 
 		 296 aa  139  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  33.8 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  32.46 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  31.99 
 
 		 293 aa  132  7.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  34.51 
 
 		 334 aa  132  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  33.89 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  34.95 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 		 326 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  33.9 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  31.9 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  25.43 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  25.43 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  27.47 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  26.03 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1470  radical SAM domain-containing protein  27.24 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.808287  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  29.12 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  33.7 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  28.9 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  34.64 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  31.18 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  28.9 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  27.34 
 
 		 333 aa  62  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0463  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.838883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  29.78 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0858  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.844085 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  32.5 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  30.29 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1058  radical SAM domain-containing protein  25.89 
 
 		 382 aa  59.3  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  31.68 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1005  radical SAM domain-containing protein  29.24 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  24.58 
 
 		 238 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0898  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  26.72 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  27.47 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  27.98 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  26.76 
 
 		 332 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  28.82 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1448  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like  32.33 
 
 		 234 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.236799 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 326 aa  54.7  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  29.91 
 
 		 336 aa  53.5  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3308  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  29.49 
 
 		 246 aa  53.1  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.760643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 324 aa  53.1  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  23.05 
 
 		 329 aa  52.8  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  23.05 
 
 		 329 aa  52.8  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  29.94 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0893  radical SAM domain-containing protein  25.43 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>