33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1787 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  100 
 
 		 312 aa  627  1e-179  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  73.72 
 
 		 312 aa  492  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  72.44 
 
 		 312 aa  480  1e-134  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  71.47 
 
 		 312 aa  464  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  42.31 
 
 		 348 aa  236  3e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  34.89 
 
 		 389 aa  158  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  32.94 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  33.33 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  42.78 
 
 		 395 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  42.86 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  30.81 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  38.51 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  27.08 
 
 		 373 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  38.86 
 
 		 387 aa  125  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  39.77 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  33.21 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  37.91 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  41.82 
 
 		 380 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  34.5 
 
 		 391 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  34.5 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  31.58 
 
 		 386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  32.75 
 
 		 387 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  27.7 
 
 		 392 aa  103  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  27.4 
 
 		 364 aa  91.7  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  29.13 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  25.38 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  24.91 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  25.68 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01650  conserved hypothetical protein  30.41 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55030  p48 polypeptide of DNA primase  26.32 
 
 		 437 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48208  predicted protein  27.65 
 
 		 398 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.180067 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41816  predicted protein  27.65 
 
 		 398 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.251296 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03033  DNA primase subunit Pri1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09020)  24.32 
 
 		 521 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.344659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>