49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1783 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  100 
 
 		 265 aa  529  1e-149  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.030089 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  85.98 
 
 		 264 aa  472  1e-132  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  83.33 
 
 		 264 aa  460  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0995  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  83.02 
 
 		 266 aa  441  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  40.82 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  36.73 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.46 
 
 		 265 aa  149  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  36.55 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.73 
 
 		 265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  34.35 
 
 		 265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  34.43 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  33.2 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  32.42 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  32.38 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  30.13 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  31.47 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  30.58 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  32.05 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  29.96 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.22 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  30.83 
 
 		 257 aa  105  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.08 
 
 		 265 aa  101  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  27.19 
 
 		 266 aa  95.9  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.51 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  25.51 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  26.89 
 
 		 266 aa  92  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  26.43 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  27.73 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  26.7 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  24.89 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  23.58 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  32 
 
 		 121 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.71 
 
 		 707 aa  46.6  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  35.9 
 
 		 559 aa  46.2  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  31.71 
 
 		 559 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  31.71 
 
 		 559 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1308  30S ribosomal protein S1  32.43 
 
 		 557 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.302956  hitchhiker  0.0000000365743 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0500  30S ribosomal protein S1  32.43 
 
 		 557 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0972  30S ribosomal protein S1  35.37 
 
 		 556 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.577662  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0902  30S ribosomal protein S1  35.37 
 
 		 556 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1027  30S ribosomal protein S1  30.11 
 
 		 563 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000294308  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3642  30S ribosomal protein S1  37.8 
 
 		 563 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0546866  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119592  Eukaryotic translation initiation factor 2, alpha subunit  22.26 
 
 		 322 aa  43.5  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0150821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1750  ribosomal protein S1  37.8 
 
 		 563 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00710774  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0920  30S ribosomal protein S1  35.37 
 
 		 556 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0956  30S ribosomal protein S1  29.27 
 
 		 573 aa  43.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000014577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  31.17 
 
 		 562 aa  43.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  35 
 
 		 811 aa  42.7  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1190  30S ribosomal protein S1  35.37 
 
 		 517 aa  42  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>