More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1769 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  86.21 
 
 		 431 aa  759    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  100 
 
 		 433 aa  860    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  86.84 
 
 		 433 aa  753    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  86.84 
 
 		 433 aa  771    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  53.69 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  50.58 
 
 		 431 aa  419  1e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.2 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  42.15 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  41.92 
 
 		 450 aa  365  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  43.09 
 
 		 450 aa  368  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  45.06 
 
 		 447 aa  364  1e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  42.89 
 
 		 449 aa  351  2e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  41.78 
 
 		 450 aa  348  1e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  41.27 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  43.29 
 
 		 444 aa  345  7e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  41.94 
 
 		 443 aa  345  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  41.69 
 
 		 450 aa  343  4e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  41.06 
 
 		 446 aa  323  3e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  39.68 
 
 		 464 aa  320  3e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  40.73 
 
 		 443 aa  318  9e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  40.38 
 
 		 437 aa  317  3e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  41.23 
 
 		 442 aa  317  4e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.75 
 
 		 468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  39.59 
 
 		 469 aa  311  1e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  39.68 
 
 		 463 aa  310  5e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  39.51 
 
 		 440 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  40 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.12 
 
 		 464 aa  302  9e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  39.81 
 
 		 444 aa  295  9e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  38.79 
 
 		 479 aa  295  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  39.58 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  39.34 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  37.79 
 
 		 492 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.85 
 
 		 490 aa  282  7.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  36.79 
 
 		 518 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.43 
 
 		 481 aa  280  5e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  39.82 
 
 		 445 aa  279  6e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  37.96 
 
 		 443 aa  277  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  37.26 
 
 		 512 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.64 
 
 		 512 aa  276  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  38.23 
 
 		 469 aa  275  9e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  38.69 
 
 		 447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  35.61 
 
 		 508 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.18 
 
 		 447 aa  273  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  36.45 
 
 		 485 aa  274  3e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  37.03 
 
 		 446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  38.17 
 
 		 449 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1202  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54) / transcription elongation factor GreB  37.56 
 
 		 495 aa  273  6e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0352571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  37.24 
 
 		 439 aa  272  7e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.77 
 
 		 446 aa  272  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1771  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.33 
 
 		 496 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  40.72 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  38.39 
 
 		 492 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  38.39 
 
 		 492 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  39.52 
 
 		 435 aa  269  7e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2535  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.51 
 
 		 483 aa  269  7e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00293209  normal  0.012093 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.38 
 
 		 447 aa  267  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  37.07 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  37.05 
 
 		 446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  35.8 
 
 		 443 aa  267  4e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  33.41 
 
 		 561 aa  266  5e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0128602 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  37.88 
 
 		 444 aa  266  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  37.15 
 
 		 449 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0296  signal recognition particle protein  37.53 
 
 		 435 aa  266  5.999999999999999e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  37.38 
 
 		 488 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  36.08 
 
 		 521 aa  265  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  36 
 
 		 441 aa  265  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  36.11 
 
 		 476 aa  264  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  36.51 
 
 		 458 aa  263  3e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  36.51 
 
 		 458 aa  263  3e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0645  signal recognition particle protein  38 
 
 		 434 aa  262  6.999999999999999e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.196271  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.45 
 
 		 443 aa  262  6.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  35.56 
 
 		 493 aa  262  8e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  34.29 
 
 		 513 aa  261  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  37.27 
 
 		 458 aa  262  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  37.27 
 
 		 458 aa  262  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  36.92 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1338  signal recognition particle protein  38 
 
 		 452 aa  260  3e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  36.21 
 
 		 449 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  36.21 
 
 		 449 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  36.21 
 
 		 449 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  36.21 
 
 		 449 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  36.21 
 
 		 449 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  35.98 
 
 		 449 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  35.98 
 
 		 449 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0181  signal recognition particle protein  35.22 
 
 		 491 aa  259  5.0000000000000005e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0376  signal recognition particle protein  35.63 
 
 		 455 aa  259  6e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751942 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3220  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.92 
 
 		 457 aa  259  7e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.604679  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.54 
 
 		 447 aa  259  8e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  35.9 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.23 
 
 		 470 aa  258  1e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  35.9 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  35.43 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  36.92 
 
 		 520 aa  258  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  35.75 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08246  hypothetical protein similar to srpA gene product (Broad)  35.89 
 
 		 542 aa  258  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0951188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  35.7 
 
 		 450 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1018  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.83 
 
 		 458 aa  257  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.868706  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0444  signal recognition particle protein  36.9 
 
 		 468 aa  257  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2887  signal recognition particle protein  37.04 
 
 		 522 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>