More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1728 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 425 aa  858    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  76.76 
 
 		 428 aa  687    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  81.41 
 
 		 425 aa  731    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  80.52 
 
 		 430 aa  705    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  54.13 
 
 		 422 aa  472  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  46.81 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  42.65 
 
 		 421 aa  331  1e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0760665 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  41.37 
 
 		 422 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 421 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.14 
 
 		 410 aa  270  5e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  37.2 
 
 		 411 aa  252  8.000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1796  beta-lactamase domain protein  37.17 
 
 		 414 aa  239  9e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  34.78 
 
 		 411 aa  237  3e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  34.58 
 
 		 411 aa  230  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.86 
 
 		 432 aa  230  4e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  33.96 
 
 		 432 aa  229  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  33.42 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3402  beta-lactamase domain protein  33.41 
 
 		 429 aa  223  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  34.09 
 
 		 433 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  32.91 
 
 		 433 aa  221  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  36.17 
 
 		 397 aa  220  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  36.3 
 
 		 642 aa  219  7.999999999999999e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 		 433 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  35.56 
 
 		 635 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  32.75 
 
 		 635 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  35.08 
 
 		 640 aa  199  6e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  34.09 
 
 		 635 aa  199  7e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 		 635 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  34.4 
 
 		 634 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 		 639 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 		 636 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 		 634 aa  195  1e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  31.19 
 
 		 635 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  31.19 
 
 		 635 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  32.64 
 
 		 639 aa  192  7e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  34.04 
 
 		 630 aa  192  7e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  31.57 
 
 		 422 aa  192  9e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  31.57 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 		 635 aa  190  4e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  31.57 
 
 		 422 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  31.53 
 
 		 637 aa  189  8e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  31.46 
 
 		 640 aa  188  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  32.33 
 
 		 630 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  32.94 
 
 		 646 aa  187  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 		 635 aa  186  5e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  32.37 
 
 		 629 aa  187  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  31.39 
 
 		 426 aa  184  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  31.89 
 
 		 636 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 		 641 aa  179  8e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  30.53 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  30.75 
 
 		 821 aa  178  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  29.89 
 
 		 644 aa  177  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  31.22 
 
 		 634 aa  175  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 		 454 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 		 454 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  31.67 
 
 		 647 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.53 
 
 		 636 aa  172  9e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  32.13 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  30.34 
 
 		 641 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  29.4 
 
 		 644 aa  171  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 		 830 aa  170  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  29.22 
 
 		 767 aa  164  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.04 
 
 		 455 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  30.32 
 
 		 465 aa  160  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  29.05 
 
 		 455 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 		 465 aa  159  8e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  28.83 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.2 
 
 		 466 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.43 
 
 		 467 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 476 aa  157  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  28.96 
 
 		 454 aa  156  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.93 
 
 		 541 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 		 460 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  29.57 
 
 		 468 aa  153  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  28.67 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  29.64 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.31 
 
 		 470 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  29.01 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  29.19 
 
 		 468 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.71 
 
 		 460 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  28.47 
 
 		 602 aa  150  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  28.63 
 
 		 469 aa  149  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  28.04 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  31.53 
 
 		 813 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5141  beta-lactamase domain-containing protein  27.99 
 
 		 577 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265268  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  27.93 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  29.71 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25.96 
 
 		 540 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  27.59 
 
 		 793 aa  147  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  29.42 
 
 		 478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 		 667 aa  147  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  28.1 
 
 		 467 aa  146  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  28.3 
 
 		 467 aa  146  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  28.67 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  27.27 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  28.6 
 
 		 467 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 		 457 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>