60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1676 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  100 
 
 
221 aa  438  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  76.02 
 
 
221 aa  350  1e-95  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  75.11 
 
 
221 aa  337  5.9999999999999996e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  75.11 
 
 
221 aa  324  7e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  49.77 
 
 
236 aa  197  7.999999999999999e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  48.26 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  43.19 
 
 
217 aa  154  8e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  42.36 
 
 
213 aa  148  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  44.15 
 
 
216 aa  142  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  30.46 
 
 
233 aa  99  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  31.22 
 
 
235 aa  82  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  35.33 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  33.96 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  30.97 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  34.67 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  29.65 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  26.7 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  30.35 
 
 
234 aa  74.7  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  26.56 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  32.28 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  29.71 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  27.91 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  26.45 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  35.67 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  29.78 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  30.19 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  37.12 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  32.31 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  29.09 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  27.66 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  35.06 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  26.14 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  31.17 
 
 
238 aa  62  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  25.91 
 
 
221 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  28.14 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  26.84 
 
 
242 aa  61.6  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  27.27 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01730  hypothetical protein  24.17 
 
 
232 aa  59.3  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00581405  hitchhiker  0.00000000634299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2205  B3/4 domain protein  31.11 
 
 
221 aa  58.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  31.05 
 
 
222 aa  58.5  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0592  B3/4 domain protein  33.33 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.557641  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  27.92 
 
 
239 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1306  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  33.6 
 
 
810 aa  52.8  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.927981  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0763  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.33 
 
 
797 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  27.92 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  25 
 
 
228 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  25.93 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  25.93 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  25 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  25.93 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  25.93 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  25.93 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02093  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
806 aa  45.4  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003705  phenylalanyl-tRNA synthetase beta chain  33.33 
 
 
801 aa  45.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.374236  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2509  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.57 
 
 
792 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28710  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.57 
 
 
792 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.458463  decreased coverage  0.000000000220958 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1455  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  26.67 
 
 
789 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105434  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0280  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.09 
 
 
807 aa  43.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0492  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.35 
 
 
792 aa  42.7  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229173  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0718  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  28.26 
 
 
671 aa  42  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>