17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1633 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1633  hypothetical protein  100 
 
 
609 aa  1242    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47966  predicted protein  29.76 
 
 
391 aa  144  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.667552  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3365  hypothetical protein  24.76 
 
 
348 aa  88.2  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.792231  normal  0.845884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0297  endo-alpha-mannosidase  25.62 
 
 
348 aa  66.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3361  hypothetical protein  20.36 
 
 
355 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.148862 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  23.11 
 
 
695 aa  60.1  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3007  hypothetical protein  22.58 
 
 
576 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  22.85 
 
 
1247 aa  55.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1412  tetratricopeptide TPR_2  25.63 
 
 
372 aa  54.3  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6326  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
787 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3784  Glycoprotein endo-alpha-1,2-mannosidase  23.27 
 
 
510 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00391126  normal  0.836971 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2508  hypothetical protein  21.6 
 
 
381 aa  52.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000156846  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2521  hypothetical protein  21.6 
 
 
381 aa  52.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540402  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4327  hypothetical protein  23.12 
 
 
414 aa  51.6  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.885566  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  25.24 
 
 
1082 aa  48.9  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0700  hypothetical protein  26.51 
 
 
366 aa  44.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0334  hypothetical protein  25.82 
 
 
358 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>